46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2001 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_2484  methicillin resistance protein  73.73 
 
 		 416 aa  653    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2436  methicillin resistance protein  73.73 
 
 		 416 aa  653    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2001  fmhA protein  100 
 
 		 415 aa  861    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1332  methicillin resistance protein  58.37 
 
 		 414 aa  498  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0318895  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1307  methicillin resistance protein  58.37 
 
 		 414 aa  498  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.200076  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0946  femA protein  43.1 
 
 		 417 aa  333  3e-90  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.70677  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1464  methicillin resistance protein  43.35 
 
 		 420 aa  329  6e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.297112  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1435  methicillin resistance protein  43.35 
 
 		 420 aa  329  6e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.452442  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1465  methicillin resistance protein  40.93 
 
 		 419 aa  299  6e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.109752  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1436  methicillin resistance protein  40.93 
 
 		 419 aa  299  6e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.250722  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0947  femB protein  39.57 
 
 		 417 aa  298  2e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.453149  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1029  hypothetical protein  30.12 
 
 		 422 aa  194  3e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1028  hypothetical protein  26.62 
 
 		 436 aa  158  2e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1027  hypothetical protein  24.76 
 
 		 426 aa  152  1e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0327  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  25.43 
 
 		 417 aa  152  1e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.297856  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0882  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  28.46 
 
 		 388 aa  145  1e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0886  Methicillin resistance protein  25.5 
 
 		 437 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1442  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  24.29 
 
 		 422 aa  135  9.999999999999999e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0644  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  29.1 
 
 		 411 aa  134  3.9999999999999996e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0508  beta-lactam resistance factor  26.02 
 
 		 411 aa  119  7.999999999999999e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0830649  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0386  peptidoglycan branched peptide synthesis protein  24.65 
 
 		 381 aa  113  6e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1349  beta-lactam resistance factor  27.06 
 
 		 411 aa  112  9e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.620165  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0510  murM protein, putative  27.99 
 
 		 406 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1112  peptidoglycan branched peptide synthesis protein  26.36 
 
 		 404 aa  110  5e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1844  femX protein  26.14 
 
 		 416 aa  107  5e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.700473  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2372  UDP-N-acetylmuramoylpentapeptide-lysine N(6)-alanyltransferase  23.51 
 
 		 396 aa  99.8  8e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2059  FemAB family protein  25.83 
 
 		 445 aa  99  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2347  FemAB family protein  25.83 
 
 		 445 aa  99  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.439209  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2288  methicillin resistance protein  23.1 
 
 		 421 aa  97.4  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00915844  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2329  methicillin resistance protein  23.1 
 
 		 421 aa  97.4  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.179607  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0509  beta-lactam resistance factor  24.63 
 
 		 403 aa  95.1  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.695705  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2417  methicillin resistance protein  24.45 
 
 		 366 aa  82  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00836283  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2408  methicillin resistance protein  36.73 
 
 		 363 aa  72  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4673  methicillin resistance protein  21.32 
 
 		 383 aa  68.6  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4843  Methicillin resistance protein  34.82 
 
 		 360 aa  66.6  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000953777  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0286  Methicillin resistance protein  22.78 
 
 		 341 aa  60.5  0.00000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2093  Methicillin resistance protein  30.63 
 
 		 346 aa  56.6  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.801885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0801  Methicillin resistance protein  22.94 
 
 		 373 aa  54.3  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1611  Methicillin resistance protein  22.97 
 
 		 370 aa  52.8  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1739  femAB family protein  30.1 
 
 		 354 aa  49.3  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00186266  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0663  hypothetical protein  29.63 
 
 		 332 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5796  Methicillin resistance protein  26.42 
 
 		 370 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1444  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  33.71 
 
 		 339 aa  45.8  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.593499  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1773  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  22.36 
 
 		 345 aa  45.4  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0083  methicillin resistance protein  26.71 
 
 		 354 aa  44.3  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0340  Methicillin resistance protein  20.22 
 
 		 394 aa  44.3  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.944256 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>