39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0644 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_0644  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  100 
 
 
411 aa  848    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0508  beta-lactam resistance factor  60.73 
 
 
411 aa  521  1e-147  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0830649  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1349  beta-lactam resistance factor  53.53 
 
 
411 aa  466  9.999999999999999e-131  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.620165  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0327  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  34.22 
 
 
417 aa  253  6e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.297856  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1029  hypothetical protein  35.07 
 
 
422 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1442  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  33.09 
 
 
422 aa  207  2e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1027  hypothetical protein  31.44 
 
 
426 aa  202  7e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0882  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  33.51 
 
 
388 aa  196  4.0000000000000005e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1028  hypothetical protein  28.04 
 
 
436 aa  168  2e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0947  femB protein  26.32 
 
 
417 aa  134  3e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.453149  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2001  fmhA protein  29.1 
 
 
415 aa  134  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1436  methicillin resistance protein  26.79 
 
 
419 aa  132  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.250722  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1465  methicillin resistance protein  26.79 
 
 
419 aa  132  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.109752  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2436  methicillin resistance protein  24.82 
 
 
416 aa  128  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2484  methicillin resistance protein  24.82 
 
 
416 aa  128  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0946  femA protein  26.49 
 
 
417 aa  125  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.70677  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1435  methicillin resistance protein  26.13 
 
 
420 aa  125  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.452442  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1307  methicillin resistance protein  26.52 
 
 
414 aa  125  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.200076  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1332  methicillin resistance protein  26.52 
 
 
414 aa  125  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0318895  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1464  methicillin resistance protein  26.13 
 
 
420 aa  125  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.297112  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0886  Methicillin resistance protein  22.54 
 
 
437 aa  97.1  6e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2329  methicillin resistance protein  27.17 
 
 
421 aa  86.3  8e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.179607  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2288  methicillin resistance protein  27.17 
 
 
421 aa  86.3  8e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00915844  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0510  murM protein, putative  25 
 
 
406 aa  86.3  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0386  peptidoglycan branched peptide synthesis protein  23.73 
 
 
381 aa  77.8  0.0000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1844  femX protein  22.79 
 
 
416 aa  75.5  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.700473  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2059  FemAB family protein  23.24 
 
 
445 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2347  FemAB family protein  23.24 
 
 
445 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.439209  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0509  beta-lactam resistance factor  21.48 
 
 
403 aa  59.7  0.00000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.695705  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4673  methicillin resistance protein  21.4 
 
 
383 aa  55.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1112  peptidoglycan branched peptide synthesis protein  22.19 
 
 
404 aa  52.8  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1773  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  41.33 
 
 
345 aa  52  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5796  Methicillin resistance protein  21.05 
 
 
370 aa  51.2  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4843  Methicillin resistance protein  19.55 
 
 
360 aa  48.9  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000953777  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2372  UDP-N-acetylmuramoylpentapeptide-lysine N(6)-alanyltransferase  22.58 
 
 
396 aa  48.1  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2093  Methicillin resistance protein  32.43 
 
 
346 aa  47.4  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.801885  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1444  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  36.84 
 
 
339 aa  45.4  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.593499  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2417  methicillin resistance protein  28.95 
 
 
366 aa  43.1  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00836283  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2408  methicillin resistance protein  29.08 
 
 
363 aa  43.1  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>