39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1028 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1028  hypothetical protein  100 
 
 
436 aa  910    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1027  hypothetical protein  40.47 
 
 
426 aa  313  4.999999999999999e-84  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1029  hypothetical protein  38.05 
 
 
422 aa  290  4e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2436  methicillin resistance protein  29.09 
 
 
416 aa  172  9e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2484  methicillin resistance protein  29.09 
 
 
416 aa  172  9e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0327  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  25.88 
 
 
417 aa  169  8e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.297856  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0644  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  28.04 
 
 
411 aa  168  2e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0508  beta-lactam resistance factor  28.77 
 
 
411 aa  166  5.9999999999999996e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0830649  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1465  methicillin resistance protein  28.34 
 
 
419 aa  164  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.109752  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1436  methicillin resistance protein  28.34 
 
 
419 aa  164  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.250722  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0947  femB protein  27.75 
 
 
417 aa  163  6e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.453149  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2001  fmhA protein  26.62 
 
 
415 aa  158  2e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1442  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  24.83 
 
 
422 aa  153  5e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1332  methicillin resistance protein  24.94 
 
 
414 aa  144  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0318895  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1307  methicillin resistance protein  24.94 
 
 
414 aa  144  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.200076  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0886  Methicillin resistance protein  26.29 
 
 
437 aa  141  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1349  beta-lactam resistance factor  25.58 
 
 
411 aa  138  3.0000000000000003e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.620165  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0946  femA protein  25.12 
 
 
417 aa  132  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.70677  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1435  methicillin resistance protein  25.17 
 
 
420 aa  130  6e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.452442  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1464  methicillin resistance protein  25.17 
 
 
420 aa  130  6e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.297112  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0882  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  23.91 
 
 
388 aa  125  2e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1844  femX protein  24.64 
 
 
416 aa  108  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.700473  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2288  methicillin resistance protein  24.03 
 
 
421 aa  106  9e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00915844  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2329  methicillin resistance protein  24.03 
 
 
421 aa  106  9e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.179607  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2347  FemAB family protein  21.45 
 
 
445 aa  98.6  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.439209  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2059  FemAB family protein  21.45 
 
 
445 aa  98.6  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0510  murM protein, putative  22.64 
 
 
406 aa  97.1  6e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0509  beta-lactam resistance factor  22.79 
 
 
403 aa  92.4  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.695705  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0386  peptidoglycan branched peptide synthesis protein  22.93 
 
 
381 aa  90.9  4e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1112  peptidoglycan branched peptide synthesis protein  23.93 
 
 
404 aa  89  2e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2372  UDP-N-acetylmuramoylpentapeptide-lysine N(6)-alanyltransferase  20.48 
 
 
396 aa  55.8  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1739  femAB family protein  25.81 
 
 
354 aa  54.7  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00186266  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4673  methicillin resistance protein  22.42 
 
 
383 aa  52.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2417  methicillin resistance protein  26.7 
 
 
366 aa  51.6  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00836283  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2408  methicillin resistance protein  25.11 
 
 
363 aa  50.4  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4843  Methicillin resistance protein  23.23 
 
 
360 aa  48.5  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000953777  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0286  Methicillin resistance protein  22.87 
 
 
341 aa  47.8  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3053  Methicillin resistance protein  27.73 
 
 
354 aa  47.4  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000266593 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3975  methicillin resistance protein  23.87 
 
 
366 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.393695 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>