48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_2436 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_2484  methicillin resistance protein  100 
 
 
416 aa  865    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2001  fmhA protein  73.73 
 
 
415 aa  653    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2436  methicillin resistance protein  100 
 
 
416 aa  865    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1332  methicillin resistance protein  60.34 
 
 
414 aa  520  1e-146  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0318895  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1307  methicillin resistance protein  60.34 
 
 
414 aa  520  1e-146  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.200076  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1464  methicillin resistance protein  43.45 
 
 
420 aa  338  9e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.297112  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1435  methicillin resistance protein  43.45 
 
 
420 aa  338  9e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.452442  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0946  femA protein  41.67 
 
 
417 aa  319  6e-86  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.70677  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0947  femB protein  40.77 
 
 
417 aa  300  2e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.453149  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1436  methicillin resistance protein  40.29 
 
 
419 aa  296  4e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.250722  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1465  methicillin resistance protein  40.29 
 
 
419 aa  296  4e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.109752  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1029  hypothetical protein  29.74 
 
 
422 aa  187  2e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1028  hypothetical protein  29.09 
 
 
436 aa  172  9e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0327  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  27.21 
 
 
417 aa  167  2.9999999999999998e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.297856  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1027  hypothetical protein  27.72 
 
 
426 aa  158  2e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0886  Methicillin resistance protein  27.52 
 
 
437 aa  153  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1442  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  26.88 
 
 
422 aa  151  2e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0882  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  28.98 
 
 
388 aa  145  2e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0644  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  24.82 
 
 
411 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0508  beta-lactam resistance factor  27.68 
 
 
411 aa  124  4e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0830649  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0386  peptidoglycan branched peptide synthesis protein  26.7 
 
 
381 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1844  femX protein  26.04 
 
 
416 aa  117  5e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.700473  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2288  methicillin resistance protein  23.49 
 
 
421 aa  116  8.999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00915844  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2329  methicillin resistance protein  23.49 
 
 
421 aa  116  8.999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.179607  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1349  beta-lactam resistance factor  25.89 
 
 
411 aa  109  7.000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.620165  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0510  murM protein, putative  26.97 
 
 
406 aa  105  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2059  FemAB family protein  25.24 
 
 
445 aa  103  5e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2347  FemAB family protein  25.24 
 
 
445 aa  103  5e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.439209  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1112  peptidoglycan branched peptide synthesis protein  24.61 
 
 
404 aa  99.4  1e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2372  UDP-N-acetylmuramoylpentapeptide-lysine N(6)-alanyltransferase  23.58 
 
 
396 aa  98.2  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2417  methicillin resistance protein  24.32 
 
 
366 aa  91.7  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00836283  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0509  beta-lactam resistance factor  23.82 
 
 
403 aa  86.7  8e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.695705  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4843  Methicillin resistance protein  35.29 
 
 
360 aa  68.9  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000953777  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2408  methicillin resistance protein  35.11 
 
 
363 aa  66.6  0.0000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0286  Methicillin resistance protein  20.11 
 
 
341 aa  57  0.0000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4673  methicillin resistance protein  24.75 
 
 
383 aa  53.5  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5796  Methicillin resistance protein  28.7 
 
 
370 aa  53.1  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0663  hypothetical protein  32.93 
 
 
332 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0801  Methicillin resistance protein  22.08 
 
 
373 aa  51.2  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3045  methicillin resistance protein  29.25 
 
 
335 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1444  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  34.83 
 
 
339 aa  48.5  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.593499  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1611  Methicillin resistance protein  23.63 
 
 
370 aa  48.5  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1739  femAB family protein  29.17 
 
 
354 aa  47.8  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00186266  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1415  methicillin resistance protein  30.89 
 
 
366 aa  46.6  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.89632  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3975  methicillin resistance protein  28.7 
 
 
366 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2093  Methicillin resistance protein  26.87 
 
 
346 aa  44.7  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.801885  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0340  Methicillin resistance protein  24.15 
 
 
394 aa  43.9  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0792  methicillin resistance protein  30.43 
 
 
337 aa  43.9  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>