45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_1307 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_1332  methicillin resistance protein  100 
 
 
414 aa  849    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0318895  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1307  methicillin resistance protein  100 
 
 
414 aa  849    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.200076  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2484  methicillin resistance protein  60.34 
 
 
416 aa  520  1e-146  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2436  methicillin resistance protein  60.34 
 
 
416 aa  520  1e-146  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2001  fmhA protein  58.37 
 
 
415 aa  498  1e-140  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0947  femB protein  38.78 
 
 
417 aa  276  5e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.453149  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1464  methicillin resistance protein  36.89 
 
 
420 aa  274  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.297112  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1435  methicillin resistance protein  36.89 
 
 
420 aa  274  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.452442  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1465  methicillin resistance protein  37.62 
 
 
419 aa  271  2e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.109752  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1436  methicillin resistance protein  37.62 
 
 
419 aa  271  2e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.250722  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0946  femA protein  38.07 
 
 
417 aa  270  2.9999999999999997e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.70677  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1029  hypothetical protein  29.74 
 
 
422 aa  201  9.999999999999999e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1442  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  28.57 
 
 
422 aa  166  5e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0327  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  26.92 
 
 
417 aa  165  1.0000000000000001e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.297856  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0886  Methicillin resistance protein  27.12 
 
 
437 aa  152  8.999999999999999e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1027  hypothetical protein  23.99 
 
 
426 aa  145  1e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1028  hypothetical protein  24.94 
 
 
436 aa  144  3e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0882  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  25.31 
 
 
388 aa  127  4.0000000000000003e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0644  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  26.52 
 
 
411 aa  125  1e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0508  beta-lactam resistance factor  25.96 
 
 
411 aa  125  1e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0830649  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0510  murM protein, putative  28.17 
 
 
406 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1349  beta-lactam resistance factor  26.32 
 
 
411 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.620165  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0386  peptidoglycan branched peptide synthesis protein  24.65 
 
 
381 aa  101  2e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2372  UDP-N-acetylmuramoylpentapeptide-lysine N(6)-alanyltransferase  23.64 
 
 
396 aa  94.4  3e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1844  femX protein  23.6 
 
 
416 aa  92  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.700473  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0509  beta-lactam resistance factor  23.21 
 
 
403 aa  90.5  5e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.695705  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1112  peptidoglycan branched peptide synthesis protein  22.79 
 
 
404 aa  87.8  3e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2288  methicillin resistance protein  21.99 
 
 
421 aa  87  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00915844  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2329  methicillin resistance protein  21.99 
 
 
421 aa  87  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.179607  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2059  FemAB family protein  26.55 
 
 
445 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2347  FemAB family protein  26.55 
 
 
445 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.439209  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4843  Methicillin resistance protein  23.81 
 
 
360 aa  69.3  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000953777  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2417  methicillin resistance protein  31.91 
 
 
366 aa  67  0.0000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00836283  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4673  methicillin resistance protein  19.31 
 
 
383 aa  65.1  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2408  methicillin resistance protein  31.91 
 
 
363 aa  63.2  0.000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0286  Methicillin resistance protein  25.71 
 
 
341 aa  59.3  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1444  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  37.33 
 
 
339 aa  52.4  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.593499  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0801  Methicillin resistance protein  23.14 
 
 
373 aa  50.4  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0340  Methicillin resistance protein  20.18 
 
 
394 aa  49.7  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5796  Methicillin resistance protein  25.26 
 
 
370 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1739  femAB family protein  26.92 
 
 
354 aa  46.6  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00186266  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5010  femAB family protein  36.36 
 
 
341 aa  45.1  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.342142  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3975  methicillin resistance protein  26.32 
 
 
366 aa  44.3  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1611  Methicillin resistance protein  34.72 
 
 
370 aa  43.9  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2093  Methicillin resistance protein  27.63 
 
 
346 aa  43.9  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.801885  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>