53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3956 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3956  hypothetical protein  100 
 
 		 369 aa  765    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000641904 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2865  hypothetical protein  43.79 
 
 		 370 aa  311  1e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0970  hypothetical protein  28.74 
 
 		 346 aa  154  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.534214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1068  hypothetical protein  28.9 
 
 		 346 aa  142  8e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3193  hypothetical protein  28.9 
 
 		 346 aa  142  8e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2873  hypothetical protein  26.7 
 
 		 380 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01304  hypothetical protein  26.3 
 
 		 357 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1775  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  29.84 
 
 		 344 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2472  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  30.23 
 
 		 344 aa  123  6e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1980  hypothetical protein  25.5 
 
 		 352 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1516  hypothetical protein  29.32 
 
 		 343 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.069659  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2969  hypothetical protein  26.06 
 
 		 346 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.852464  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3065  hypothetical protein  27.76 
 
 		 348 aa  110  5e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0204721  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0665  hypothetical protein  25.07 
 
 		 345 aa  107  5e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0449506  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2344  hypothetical protein  27.34 
 
 		 344 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2469  hypothetical protein  27.36 
 
 		 344 aa  105  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0288  hypothetical protein  28.16 
 
 		 354 aa  104  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3275  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  26.67 
 
 		 353 aa  100  6e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.299337  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2216  FemAB-related protein, PEP-CTERM system- associated  24.92 
 
 		 342 aa  99  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0832  hypothetical protein  25.08 
 
 		 349 aa  94.4  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00050056  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0683  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  25.17 
 
 		 348 aa  93.6  5e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2511  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  24.75 
 
 		 356 aa  92.4  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.723604 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2369  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  24.71 
 
 		 368 aa  92.4  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2404  hypothetical protein  25.09 
 
 		 344 aa  90.5  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2523  hypothetical protein  24.33 
 
 		 361 aa  89.7  7e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.193947  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4037  hypothetical protein  23.1 
 
 		 349 aa  89  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.493535  normal  0.627077 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0142  hypothetical protein  23.28 
 
 		 350 aa  87.8  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.103004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0589  hypothetical protein  25.57 
 
 		 347 aa  87  5e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.611508 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1922  hypothetical protein  23.49 
 
 		 355 aa  75.9  0.0000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.26263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1195  hypothetical protein  21.8 
 
 		 355 aa  75.5  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3113  hypothetical protein  26.28 
 
 		 345 aa  75.1  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0138  hypothetical protein  21.2 
 
 		 471 aa  66.6  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0233537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0719  hypothetical protein  23.87 
 
 		 333 aa  61.2  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00617075  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1611  Methicillin resistance protein  21.05 
 
 		 370 aa  56.6  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2330  hypothetical protein  20.88 
 
 		 351 aa  55.8  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1528  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2169  hypothetical protein  24.53 
 
 		 360 aa  55.1  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.764152  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2408  methicillin resistance protein  22.68 
 
 		 363 aa  55.5  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0663  hypothetical protein  22.56 
 
 		 332 aa  53.5  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4843  Methicillin resistance protein  21.36 
 
 		 360 aa  53.5  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000953777  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3045  methicillin resistance protein  23.2 
 
 		 335 aa  53.5  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1609  Methicillin resistance protein  23.81 
 
 		 347 aa  52.4  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1739  femAB family protein  23.26 
 
 		 354 aa  52.4  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00186266  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0083  methicillin resistance protein  26.92 
 
 		 354 aa  50.1  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2417  methicillin resistance protein  21.78 
 
 		 366 aa  48.1  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00836283  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1138  hypothetical protein  26.19 
 
 		 324 aa  44.3  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2501  hypothetical protein  20.82 
 
 		 353 aa  44.3  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2310  hypothetical protein  27.97 
 
 		 324 aa  43.9  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.108131 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5796  Methicillin resistance protein  23.18 
 
 		 370 aa  43.9  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2411  protein of unknown function DUF482  23.08 
 
 		 372 aa  43.9  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1399  hypothetical protein  20.27 
 
 		 350 aa  43.5  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0922  hypothetical protein  25.83 
 
 		 307 aa  42.7  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0961  methicillin resistance protein  26.32 
 
 		 359 aa  42.7  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5010  femAB family protein  21.97 
 
 		 341 aa  42.7  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.342142  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>