30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0719 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0719  hypothetical protein  100 
 
 
333 aa  678    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00617075  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2169  hypothetical protein  32.54 
 
 
360 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.764152  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3956  hypothetical protein  23.87 
 
 
369 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000641904 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1922  hypothetical protein  23.05 
 
 
355 aa  61.2  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.26263  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2865  hypothetical protein  23.73 
 
 
370 aa  60.8  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1609  Methicillin resistance protein  22.29 
 
 
347 aa  58.5  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3053  Methicillin resistance protein  22.99 
 
 
354 aa  57.8  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000266593 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1516  hypothetical protein  21.93 
 
 
343 aa  56.2  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.069659  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0970  hypothetical protein  23.23 
 
 
346 aa  56.2  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.534214  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4843  Methicillin resistance protein  25.15 
 
 
360 aa  55.8  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000953777  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0683  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  23.87 
 
 
348 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2472  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  23.77 
 
 
344 aa  55.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5010  femAB family protein  23.03 
 
 
341 aa  54.7  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.342142  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0832  hypothetical protein  22.64 
 
 
349 aa  54.3  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00050056  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1775  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  24.07 
 
 
344 aa  53.9  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2344  hypothetical protein  23.2 
 
 
344 aa  53.5  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2469  hypothetical protein  22.15 
 
 
344 aa  51.6  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3975  methicillin resistance protein  20.18 
 
 
366 aa  49.7  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2411  protein of unknown function DUF482  23 
 
 
372 aa  49.7  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1195  hypothetical protein  19.74 
 
 
355 aa  49.7  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0885  Methicillin resistance protein  26.73 
 
 
357 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1980  hypothetical protein  20.22 
 
 
352 aa  48.1  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2312  hypothetical protein  23.12 
 
 
343 aa  47.8  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3065  hypothetical protein  22.55 
 
 
348 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0204721  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2417  methicillin resistance protein  22.4 
 
 
366 aa  46.2  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00836283  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1425  hypothetical protein  22.36 
 
 
335 aa  46.2  0.0009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2873  hypothetical protein  20.06 
 
 
380 aa  45.4  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0286  Methicillin resistance protein  25.15 
 
 
341 aa  45.4  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2715  hypothetical protein  22.8 
 
 
238 aa  43.1  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2408  methicillin resistance protein  21.54 
 
 
363 aa  42.7  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>