55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2865 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2865  hypothetical protein  100 
 
 
370 aa  769    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3956  hypothetical protein  43.79 
 
 
369 aa  311  1e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000641904 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0970  hypothetical protein  30.32 
 
 
346 aa  168  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.534214  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3193  hypothetical protein  24.5 
 
 
346 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1068  hypothetical protein  25.64 
 
 
346 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2969  hypothetical protein  25.89 
 
 
346 aa  127  3e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.852464  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2344  hypothetical protein  27.84 
 
 
344 aa  123  6e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2469  hypothetical protein  27.63 
 
 
344 aa  122  7e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1775  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  27.92 
 
 
344 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2472  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  27.67 
 
 
344 aa  110  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3065  hypothetical protein  25.72 
 
 
348 aa  110  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0204721  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2404  hypothetical protein  27.1 
 
 
344 aa  110  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2873  hypothetical protein  27.09 
 
 
380 aa  110  5e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0288  hypothetical protein  26.99 
 
 
354 aa  109  7.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2216  FemAB-related protein, PEP-CTERM system- associated  28.08 
 
 
342 aa  108  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2511  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  26.35 
 
 
356 aa  106  7e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.723604 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1516  hypothetical protein  26.91 
 
 
343 aa  105  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.069659  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0832  hypothetical protein  25.91 
 
 
349 aa  104  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00050056  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0665  hypothetical protein  26.59 
 
 
345 aa  102  8e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0449506  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1980  hypothetical protein  27 
 
 
352 aa  101  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0683  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  26.69 
 
 
348 aa  101  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3275  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  25.64 
 
 
353 aa  100  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.299337  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2523  hypothetical protein  25.51 
 
 
361 aa  96.3  7e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.193947  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4037  hypothetical protein  23.85 
 
 
349 aa  92.8  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.493535  normal  0.627077 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01304  hypothetical protein  25.25 
 
 
357 aa  91.7  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2369  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  24.44 
 
 
368 aa  82.4  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3113  hypothetical protein  24.57 
 
 
345 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0142  hypothetical protein  23.63 
 
 
350 aa  77  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.103004  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0589  hypothetical protein  23.28 
 
 
347 aa  70.9  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.611508 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2408  methicillin resistance protein  25.31 
 
 
363 aa  66.2  0.0000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2330  hypothetical protein  22.5 
 
 
351 aa  65.1  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1528  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0286  Methicillin resistance protein  22.37 
 
 
341 aa  63.9  0.000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3045  methicillin resistance protein  24.51 
 
 
335 aa  63.9  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4843  Methicillin resistance protein  22 
 
 
360 aa  63.5  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000953777  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1195  hypothetical protein  20.96 
 
 
355 aa  62.4  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0138  hypothetical protein  20.7 
 
 
471 aa  62.4  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0233537  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2417  methicillin resistance protein  22.15 
 
 
366 aa  62  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00836283  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0719  hypothetical protein  23.73 
 
 
333 aa  60.8  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00617075  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1922  hypothetical protein  20.29 
 
 
355 aa  61.2  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.26263  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1739  femAB family protein  25.32 
 
 
354 aa  60.1  0.00000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00186266  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3053  Methicillin resistance protein  26.3 
 
 
354 aa  58.2  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000266593 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0663  hypothetical protein  22.48 
 
 
332 aa  57.4  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1611  Methicillin resistance protein  21.93 
 
 
370 aa  56.6  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2858  methicillin resistance protein  20.19 
 
 
342 aa  56.2  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0083  methicillin resistance protein  21.98 
 
 
354 aa  53.1  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2411  protein of unknown function DUF482  20.89 
 
 
372 aa  48.5  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2169  hypothetical protein  21.62 
 
 
360 aa  47.4  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.764152  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1609  Methicillin resistance protein  21.74 
 
 
347 aa  47  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0340  Methicillin resistance protein  21.43 
 
 
394 aa  46.2  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2312  hypothetical protein  26.6 
 
 
343 aa  45.4  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0739  methicillin resistance protein  25 
 
 
368 aa  44.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.274792  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1773  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  23.23 
 
 
345 aa  43.9  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2329  methicillin resistance protein  24.07 
 
 
421 aa  43.1  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.179607  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3975  methicillin resistance protein  20.55 
 
 
366 aa  43.1  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2288  methicillin resistance protein  24.07 
 
 
421 aa  43.1  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00915844  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>