81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2472 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1775  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  94.19 
 
 		 344 aa  682    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2472  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  100 
 
 		 344 aa  713    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2469  hypothetical protein  64.71 
 
 		 344 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2344  hypothetical protein  59.28 
 
 		 344 aa  422  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2216  FemAB-related protein, PEP-CTERM system- associated  56.67 
 
 		 342 aa  386  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0683  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  52.99 
 
 		 348 aa  352  5e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3065  hypothetical protein  52.12 
 
 		 348 aa  349  4e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0204721  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2369  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  41.82 
 
 		 368 aa  269  4e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0138  hypothetical protein  41.47 
 
 		 471 aa  266  2.9999999999999995e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0233537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1516  hypothetical protein  36.72 
 
 		 343 aa  217  2e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.069659  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3275  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  38.05 
 
 		 353 aa  211  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.299337  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1980  hypothetical protein  33.63 
 
 		 352 aa  210  2e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2511  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  33.72 
 
 		 356 aa  211  2e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.723604 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2969  hypothetical protein  35.94 
 
 		 346 aa  209  8e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.852464  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0288  hypothetical protein  35.29 
 
 		 354 aa  208  1e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2404  hypothetical protein  36.75 
 
 		 344 aa  207  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2523  hypothetical protein  32.63 
 
 		 361 aa  205  1e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.193947  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0142  hypothetical protein  35.94 
 
 		 350 aa  204  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.103004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1922  hypothetical protein  36.78 
 
 		 355 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.26263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01304  hypothetical protein  35.45 
 
 		 357 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0589  hypothetical protein  32.12 
 
 		 347 aa  196  7e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.611508 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0665  hypothetical protein  33.43 
 
 		 345 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0449506  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0832  hypothetical protein  32.84 
 
 		 349 aa  192  5e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00050056  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1195  hypothetical protein  33.14 
 
 		 355 aa  192  8e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4037  hypothetical protein  32.95 
 
 		 349 aa  171  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.493535  normal  0.627077 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2330  hypothetical protein  32.57 
 
 		 351 aa  160  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1528  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3113  hypothetical protein  32.16 
 
 		 345 aa  155  6e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0970  hypothetical protein  26.22 
 
 		 346 aa  131  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.534214  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3956  hypothetical protein  30.23 
 
 		 369 aa  123  6e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000641904 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2865  hypothetical protein  27.67 
 
 		 370 aa  110  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2873  hypothetical protein  24.29 
 
 		 380 aa  108  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1068  hypothetical protein  25.87 
 
 		 346 aa  94  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3193  hypothetical protein  24.58 
 
 		 346 aa  87.8  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3045  methicillin resistance protein  27.78 
 
 		 335 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0083  methicillin resistance protein  21.32 
 
 		 354 aa  74.3  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3975  methicillin resistance protein  25.62 
 
 		 366 aa  73.2  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2169  hypothetical protein  24.76 
 
 		 360 aa  69.3  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.764152  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4843  Methicillin resistance protein  21.98 
 
 		 360 aa  67.4  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000953777  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0663  hypothetical protein  25.73 
 
 		 332 aa  66.6  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1739  femAB family protein  26.92 
 
 		 354 aa  64.7  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00186266  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2342  hypothetical protein  27.89 
 
 		 352 aa  61.6  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2728  protein of unknown function DUF482  23.85 
 
 		 360 aa  59.3  0.00000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.482238  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3053  Methicillin resistance protein  21.39 
 
 		 354 aa  58.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000266593 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0286  Methicillin resistance protein  21.8 
 
 		 341 aa  56.6  0.0000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0719  hypothetical protein  23.77 
 
 		 333 aa  55.5  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00617075  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1247  femAB family protein  21.5 
 
 		 352 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4673  methicillin resistance protein  28.74 
 
 		 383 aa  55.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1609  Methicillin resistance protein  20.32 
 
 		 347 aa  55.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2417  methicillin resistance protein  24 
 
 		 366 aa  54.3  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00836283  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0792  methicillin resistance protein  22.16 
 
 		 337 aa  53.9  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114115  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1611  Methicillin resistance protein  24.87 
 
 		 370 aa  53.5  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1444  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  27.78 
 
 		 339 aa  53.5  0.000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.593499  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1667  hypothetical protein  31.02 
 
 		 404 aa  52  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2312  hypothetical protein  23.51 
 
 		 343 aa  52  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2853  hypothetical protein  23.39 
 
 		 348 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.957178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1415  methicillin resistance protein  20.15 
 
 		 366 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.89632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0340  Methicillin resistance protein  26.51 
 
 		 394 aa  50.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2314  hypothetical protein  22.33 
 
 		 338 aa  51.2  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1399  hypothetical protein  25.42 
 
 		 350 aa  50.1  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5671  hypothetical protein  24.54 
 
 		 293 aa  49.7  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.597001  normal  0.0100919 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2852  hypothetical protein  25.15 
 
 		 293 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000023268 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2408  methicillin resistance protein  23.6 
 
 		 363 aa  49.3  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5796  Methicillin resistance protein  27.22 
 
 		 370 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5355  hypothetical protein  27.36 
 
 		 359 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0746954 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2313  hypothetical protein  21.74 
 
 		 342 aa  47.8  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2501  hypothetical protein  19.76 
 
 		 353 aa  47  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0886  Methicillin resistance protein  22.8 
 
 		 437 aa  46.6  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2359  protein of unknown function DUF482  27.23 
 
 		 393 aa  45.8  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.597494  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8162  Methicillin resistance protein  26.55 
 
 		 343 aa  45.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848631  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2411  protein of unknown function DUF482  22.4 
 
 		 372 aa  45.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1138  hypothetical protein  21.6 
 
 		 324 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1393  hypothetical protein  23.49 
 
 		 331 aa  44.7  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.238447  normal  0.393853 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2114  hypothetical protein  24.25 
 
 		 391 aa  44.7  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0393548 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2093  Methicillin resistance protein  19.8 
 
 		 346 aa  43.9  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.801885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22410  hypothetical protein  24.57 
 
 		 374 aa  43.9  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000252116 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3500  protein of unknown function DUF482  25.62 
 
 		 388 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3837  hypothetical protein  26.32 
 
 		 375 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.29195  normal  0.855927 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1528  hypothetical protein  24.43 
 
 		 354 aa  43.5  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1896  hypothetical protein  29.17 
 
 		 374 aa  42.7  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.376681  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1294  Methicillin resistance protein  22.48 
 
 		 340 aa  42.7  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.402759 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1256  Methicillin resistance protein  21.54 
 
 		 347 aa  42.7  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000274445 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>