63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1516 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1516  hypothetical protein  100 
 
 		 343 aa  703    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.069659  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0142  hypothetical protein  63.05 
 
 		 350 aa  440  9.999999999999999e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.103004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2511  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  61 
 
 		 356 aa  431  1e-120  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.723604 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2523  hypothetical protein  56.89 
 
 		 361 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.193947  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3275  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  57.06 
 
 		 353 aa  399  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.299337  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0665  hypothetical protein  56.81 
 
 		 345 aa  394  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0449506  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1980  hypothetical protein  55.72 
 
 		 352 aa  394  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0288  hypothetical protein  58.36 
 
 		 354 aa  391  1e-108  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2404  hypothetical protein  55.65 
 
 		 344 aa  388  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2969  hypothetical protein  53.18 
 
 		 346 aa  353  2.9999999999999997e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.852464  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0589  hypothetical protein  51.83 
 
 		 347 aa  338  7e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.611508 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3113  hypothetical protein  44.64 
 
 		 345 aa  287  2e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4037  hypothetical protein  44.48 
 
 		 349 aa  270  4e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.493535  normal  0.627077 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1922  hypothetical protein  42.18 
 
 		 355 aa  261  2e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.26263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2330  hypothetical protein  45.73 
 
 		 351 aa  249  4e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1528  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2344  hypothetical protein  37.1 
 
 		 344 aa  224  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2472  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  36.72 
 
 		 344 aa  217  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2469  hypothetical protein  35.65 
 
 		 344 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1775  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  34.51 
 
 		 344 aa  208  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2216  FemAB-related protein, PEP-CTERM system- associated  33.23 
 
 		 342 aa  206  5e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0683  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  33.53 
 
 		 348 aa  195  1e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3065  hypothetical protein  33.81 
 
 		 348 aa  192  9e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0204721  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2369  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  32.74 
 
 		 368 aa  186  5e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0832  hypothetical protein  30.11 
 
 		 349 aa  170  3e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00050056  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0138  hypothetical protein  29.04 
 
 		 471 aa  146  4.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0233537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1195  hypothetical protein  26.39 
 
 		 355 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01304  hypothetical protein  24.64 
 
 		 357 aa  121  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3956  hypothetical protein  29.32 
 
 		 369 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000641904 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2865  hypothetical protein  26.91 
 
 		 370 aa  105  9e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1068  hypothetical protein  23.8 
 
 		 346 aa  96.7  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3193  hypothetical protein  23.23 
 
 		 346 aa  95.5  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2873  hypothetical protein  23.19 
 
 		 380 aa  89.4  8e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0970  hypothetical protein  26.19 
 
 		 346 aa  89.4  9e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.534214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2501  hypothetical protein  22.66 
 
 		 353 aa  74.3  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2728  protein of unknown function DUF482  24.78 
 
 		 360 aa  73.6  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.482238  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2169  hypothetical protein  26.06 
 
 		 360 aa  70.5  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.764152  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3045  methicillin resistance protein  26.92 
 
 		 335 aa  64.3  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2411  protein of unknown function DUF482  22.4 
 
 		 372 aa  62.8  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0663  hypothetical protein  26.21 
 
 		 332 aa  56.6  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0719  hypothetical protein  21.93 
 
 		 333 aa  56.2  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00617075  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5796  Methicillin resistance protein  25 
 
 		 370 aa  56.2  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2310  hypothetical protein  26.13 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.108131 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00204  hypothetical protein  26.14 
 
 		 310 aa  54.7  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0083  methicillin resistance protein  23.05 
 
 		 354 aa  54.3  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1415  methicillin resistance protein  22.14 
 
 		 366 aa  53.9  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.89632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2114  hypothetical protein  26.03 
 
 		 391 aa  52.4  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0393548 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0286  Methicillin resistance protein  19.87 
 
 		 341 aa  50.8  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3975  methicillin resistance protein  22.22 
 
 		 366 aa  50.1  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4673  methicillin resistance protein  25.6 
 
 		 383 aa  49.3  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3053  Methicillin resistance protein  24.2 
 
 		 354 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000266593 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2963  FAD binding domain-containing protein  25.61 
 
 		 805 aa  47.8  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000276895 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0739  methicillin resistance protein  24.5 
 
 		 368 aa  47.8  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.274792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2614  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.61 
 
 		 805 aa  47  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.258933  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0715  hypothetical protein  21.11 
 
 		 321 aa  46.6  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.821886  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1249  hypothetical protein  30.2 
 
 		 374 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.25813 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3425  hypothetical protein  23.81 
 
 		 313 aa  45.4  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.143139  normal  0.528642 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0487  hypothetical protein  24.84 
 
 		 362 aa  44.3  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2734  hypothetical protein  28.18 
 
 		 385 aa  44.3  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1113  hypothetical protein  23.83 
 
 		 335 aa  44.3  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.79737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4685  protein of unknown function DUF482  29.7 
 
 		 406 aa  43.9  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2475  hypothetical protein  32.35 
 
 		 395 aa  43.5  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.407377  normal  0.0590595 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2408  methicillin resistance protein  20.24 
 
 		 363 aa  43.1  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2314  hypothetical protein  22.89 
 
 		 338 aa  42.7  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>