18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00204 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_00204  hypothetical protein  100 
 
 
310 aa  621  1e-177  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1303  hypothetical protein  42.9 
 
 
312 aa  271  1e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.805165  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3425  hypothetical protein  44.44 
 
 
313 aa  259  3e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.143139  normal  0.528642 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2236  hypothetical protein  32.47 
 
 
325 aa  192  6e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2310  hypothetical protein  36.01 
 
 
324 aa  176  7e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.108131 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09383  hypothetical protein  33.45 
 
 
290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.474977  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1138  hypothetical protein  30.12 
 
 
324 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1425  hypothetical protein  28.4 
 
 
335 aa  109  5e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0715  hypothetical protein  24.83 
 
 
321 aa  88.2  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.821886  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1516  hypothetical protein  25.48 
 
 
343 aa  55.8  0.0000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.069659  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2344  hypothetical protein  26.42 
 
 
344 aa  49.3  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2369  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  21.9 
 
 
368 aa  47.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0589  hypothetical protein  25.58 
 
 
347 aa  47  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.611508 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3275  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  24.81 
 
 
353 aa  47  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.299337  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0142  hypothetical protein  21.83 
 
 
350 aa  45.8  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.103004  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3956  hypothetical protein  26.53 
 
 
369 aa  44.3  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000641904 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2404  hypothetical protein  22.61 
 
 
344 aa  44.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2523  hypothetical protein  22.76 
 
 
361 aa  44.3  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.193947  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>