19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2310 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_2310  hypothetical protein  100 
 
 
324 aa  667    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.108131 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3425  hypothetical protein  39.56 
 
 
313 aa  224  1e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.143139  normal  0.528642 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2236  hypothetical protein  36.21 
 
 
325 aa  213  3.9999999999999995e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1303  hypothetical protein  33.76 
 
 
312 aa  187  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.805165  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00204  hypothetical protein  36.1 
 
 
310 aa  177  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1138  hypothetical protein  28.57 
 
 
324 aa  159  5e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09383  hypothetical protein  30.5 
 
 
290 aa  148  1.0000000000000001e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.474977  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1425  hypothetical protein  28.66 
 
 
335 aa  116  6e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0715  hypothetical protein  25.4 
 
 
321 aa  85.9  8e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.821886  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1516  hypothetical protein  26.13 
 
 
343 aa  65.9  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.069659  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0142  hypothetical protein  24.36 
 
 
350 aa  60.1  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.103004  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3956  hypothetical protein  27.97 
 
 
369 aa  53.1  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000641904 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0589  hypothetical protein  23.41 
 
 
347 aa  49.3  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.611508 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3275  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  23.55 
 
 
353 aa  49.3  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.299337  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2508  hypothetical protein  28.31 
 
 
300 aa  47.4  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2469  hypothetical protein  22.26 
 
 
344 aa  47  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2523  hypothetical protein  23.31 
 
 
361 aa  47  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.193947  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2472  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  21.14 
 
 
344 aa  45.8  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2511  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  22.19 
 
 
356 aa  43.1  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.723604 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>