43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3275 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3275  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  100 
 
 
353 aa  725    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.299337  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2404  hypothetical protein  69.1 
 
 
344 aa  491  9.999999999999999e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0665  hypothetical protein  66.37 
 
 
345 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0449506  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2523  hypothetical protein  58.55 
 
 
361 aa  426  1e-118  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.193947  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0288  hypothetical protein  59.42 
 
 
354 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1980  hypothetical protein  57.02 
 
 
352 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0142  hypothetical protein  59.13 
 
 
350 aa  404  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.103004  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1516  hypothetical protein  57.06 
 
 
343 aa  399  9.999999999999999e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.069659  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2511  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  57.73 
 
 
356 aa  395  1e-109  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.723604 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2969  hypothetical protein  53.8 
 
 
346 aa  323  2e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.852464  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0589  hypothetical protein  49.26 
 
 
347 aa  321  9.999999999999999e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.611508 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3113  hypothetical protein  44.54 
 
 
345 aa  277  2e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1922  hypothetical protein  45.03 
 
 
355 aa  262  6e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.26263  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4037  hypothetical protein  43.88 
 
 
349 aa  256  3e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.493535  normal  0.627077 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2330  hypothetical protein  41.95 
 
 
351 aa  237  2e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1528  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2472  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  38.05 
 
 
344 aa  211  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1775  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  36.9 
 
 
344 aa  207  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2344  hypothetical protein  36.36 
 
 
344 aa  206  5e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2469  hypothetical protein  36.72 
 
 
344 aa  194  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0683  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  33.04 
 
 
348 aa  176  5e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2369  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  33.14 
 
 
368 aa  176  7e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3065  hypothetical protein  31.36 
 
 
348 aa  171  2e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0204721  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2216  FemAB-related protein, PEP-CTERM system- associated  32.14 
 
 
342 aa  167  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0138  hypothetical protein  31.62 
 
 
471 aa  160  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0233537  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1195  hypothetical protein  25.98 
 
 
355 aa  133  5e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0832  hypothetical protein  28.61 
 
 
349 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00050056  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01304  hypothetical protein  25.28 
 
 
357 aa  107  4e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2865  hypothetical protein  25.64 
 
 
370 aa  100  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3956  hypothetical protein  26.67 
 
 
369 aa  100  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000641904 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1068  hypothetical protein  23.65 
 
 
346 aa  94.7  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3193  hypothetical protein  23.58 
 
 
346 aa  92.4  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0970  hypothetical protein  26.56 
 
 
346 aa  84  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.534214  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2873  hypothetical protein  22.03 
 
 
380 aa  80.9  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2411  protein of unknown function DUF482  23.99 
 
 
372 aa  55.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2408  methicillin resistance protein  21.55 
 
 
363 aa  55.1  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2501  hypothetical protein  20.97 
 
 
353 aa  53.9  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3045  methicillin resistance protein  26.43 
 
 
335 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0083  methicillin resistance protein  21.39 
 
 
354 aa  49.7  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2728  protein of unknown function DUF482  21.7 
 
 
360 aa  47.4  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.482238  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00204  hypothetical protein  25.73 
 
 
310 aa  47  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0286  Methicillin resistance protein  20.47 
 
 
341 aa  46.2  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3975  methicillin resistance protein  21.88 
 
 
366 aa  43.9  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1415  methicillin resistance protein  19.72 
 
 
366 aa  42.7  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.89632  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>