55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0142 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0142  hypothetical protein  100 
 
 
350 aa  722    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.103004  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2511  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  69.94 
 
 
356 aa  499  1e-140  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.723604 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2523  hypothetical protein  64.81 
 
 
361 aa  480  1e-134  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.193947  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0288  hypothetical protein  67.24 
 
 
354 aa  455  1e-127  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1516  hypothetical protein  63.05 
 
 
343 aa  452  1.0000000000000001e-126  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.069659  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2404  hypothetical protein  59.59 
 
 
344 aa  419  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1980  hypothetical protein  57.65 
 
 
352 aa  415  9.999999999999999e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3275  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  59.13 
 
 
353 aa  412  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.299337  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0665  hypothetical protein  57.56 
 
 
345 aa  397  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0449506  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0589  hypothetical protein  51.05 
 
 
347 aa  348  1e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.611508 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2969  hypothetical protein  54.01 
 
 
346 aa  343  2e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.852464  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3113  hypothetical protein  47.06 
 
 
345 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4037  hypothetical protein  45.37 
 
 
349 aa  262  6.999999999999999e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.493535  normal  0.627077 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1922  hypothetical protein  42.34 
 
 
355 aa  235  8e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.26263  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2344  hypothetical protein  37.69 
 
 
344 aa  227  3e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2469  hypothetical protein  37.08 
 
 
344 aa  223  4e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2330  hypothetical protein  42.55 
 
 
351 aa  221  9.999999999999999e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1528  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2216  FemAB-related protein, PEP-CTERM system- associated  35.63 
 
 
342 aa  211  1e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2472  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  35.94 
 
 
344 aa  208  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1775  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  35.01 
 
 
344 aa  206  4e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3065  hypothetical protein  36.61 
 
 
348 aa  204  2e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0204721  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0683  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  34.29 
 
 
348 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2369  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  31.33 
 
 
368 aa  176  4e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0138  hypothetical protein  30.37 
 
 
471 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0233537  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0832  hypothetical protein  29.94 
 
 
349 aa  169  5e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00050056  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01304  hypothetical protein  26.35 
 
 
357 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1195  hypothetical protein  26.45 
 
 
355 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1068  hypothetical protein  23.1 
 
 
346 aa  104  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3193  hypothetical protein  22.51 
 
 
346 aa  102  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2873  hypothetical protein  23.36 
 
 
380 aa  95.1  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3956  hypothetical protein  23.28 
 
 
369 aa  91.7  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000641904 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2865  hypothetical protein  23.63 
 
 
370 aa  84.7  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0970  hypothetical protein  24.85 
 
 
346 aa  80.5  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.534214  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3045  methicillin resistance protein  26.21 
 
 
335 aa  63.5  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2728  protein of unknown function DUF482  23.25 
 
 
360 aa  58.5  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.482238  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2408  methicillin resistance protein  23.39 
 
 
363 aa  55.5  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2501  hypothetical protein  21.56 
 
 
353 aa  55.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2310  hypothetical protein  24.76 
 
 
324 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.108131 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1113  hypothetical protein  22.22 
 
 
335 aa  52.8  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.79737  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0739  methicillin resistance protein  23.43 
 
 
368 aa  51.6  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.274792  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2169  hypothetical protein  21.89 
 
 
360 aa  50.1  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.764152  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0083  methicillin resistance protein  20.85 
 
 
354 aa  50.1  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1303  hypothetical protein  18.97 
 
 
312 aa  47.8  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.805165  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2093  Methicillin resistance protein  23.49 
 
 
346 aa  46.6  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.801885  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2312  hypothetical protein  24.1 
 
 
343 aa  45.8  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1138  hypothetical protein  19.23 
 
 
324 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3053  Methicillin resistance protein  21.81 
 
 
354 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000266593 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3975  methicillin resistance protein  19.86 
 
 
366 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2715  hypothetical protein  23.93 
 
 
238 aa  44.7  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2411  protein of unknown function DUF482  21.12 
 
 
372 aa  43.9  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4843  Methicillin resistance protein  25 
 
 
360 aa  43.9  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000953777  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00204  hypothetical protein  22.41 
 
 
310 aa  43.5  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0135  protein of unknown function DUF482  29.81 
 
 
406 aa  43.1  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2734  hypothetical protein  28.69 
 
 
385 aa  43.1  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1415  methicillin resistance protein  20.43 
 
 
366 aa  42.7  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.89632  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>