39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2501 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2501  hypothetical protein  100 
 
 
353 aa  725    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2411  protein of unknown function DUF482  39.94 
 
 
372 aa  256  3e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2728  protein of unknown function DUF482  36.28 
 
 
360 aa  228  1e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.482238  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1516  hypothetical protein  22.66 
 
 
343 aa  74.3  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.069659  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0832  hypothetical protein  22.29 
 
 
349 aa  70.1  0.00000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00050056  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1195  hypothetical protein  22.6 
 
 
355 aa  65.9  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2342  hypothetical protein  23.85 
 
 
352 aa  63.9  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2344  hypothetical protein  22.42 
 
 
344 aa  62.4  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3065  hypothetical protein  22.78 
 
 
348 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0204721  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2169  hypothetical protein  24.65 
 
 
360 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.764152  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0683  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  20.91 
 
 
348 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5378  GCN5-related N-acetyltransferase  23.55 
 
 
363 aa  55.8  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2634  hypothetical protein  23.71 
 
 
377 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0584962  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2511  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  21.05 
 
 
356 aa  54.3  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.723604 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0142  hypothetical protein  21.62 
 
 
350 aa  54.3  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.103004  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3275  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  20.97 
 
 
353 aa  53.9  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.299337  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2969  hypothetical protein  20.06 
 
 
346 aa  53.5  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.852464  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2469  hypothetical protein  21.29 
 
 
344 aa  52  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0663  hypothetical protein  26.67 
 
 
332 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2369  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  21.36 
 
 
368 aa  50.8  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2408  methicillin resistance protein  21.69 
 
 
363 aa  50.1  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3045  methicillin resistance protein  25 
 
 
335 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3017  hypothetical protein  21.41 
 
 
384 aa  48.5  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1980  hypothetical protein  19.29 
 
 
352 aa  47.4  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2472  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  19.76 
 
 
344 aa  47  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4673  methicillin resistance protein  25.6 
 
 
383 aa  46.6  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3975  methicillin resistance protein  21.13 
 
 
366 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0220  hypothetical protein  27.01 
 
 
331 aa  45.8  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.186583  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01036  hypothetical protein  24.84 
 
 
388 aa  45.1  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0479769  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06130  hypothetical protein  24.84 
 
 
388 aa  45.1  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.187585  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2871  hypothetical protein  22.71 
 
 
388 aa  45.1  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1775  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  19.63 
 
 
344 aa  45.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3956  hypothetical protein  20.82 
 
 
369 aa  44.3  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000641904 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1611  Methicillin resistance protein  24.51 
 
 
370 aa  44.7  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2216  FemAB-related protein, PEP-CTERM system- associated  20.71 
 
 
342 aa  43.5  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2417  methicillin resistance protein  21.02 
 
 
366 aa  43.1  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00836283  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1114  protein of unknown function DUF482  24.57 
 
 
392 aa  43.1  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.333144 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1415  methicillin resistance protein  23.94 
 
 
366 aa  42.7  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.89632  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2114  hypothetical protein  20.86 
 
 
391 aa  42.7  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0393548 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>