38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3113 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3113  hypothetical protein  100 
 
 		 345 aa  709    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2511  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  50.15 
 
 		 356 aa  329  4e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.723604 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1516  hypothetical protein  44.64 
 
 		 343 aa  307  2.0000000000000002e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.069659  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2523  hypothetical protein  46.39 
 
 		 361 aa  306  4.0000000000000004e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.193947  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1980  hypothetical protein  45.29 
 
 		 352 aa  305  7e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3275  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  45.98 
 
 		 353 aa  299  4e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.299337  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0142  hypothetical protein  47.06 
 
 		 350 aa  298  1e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.103004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2404  hypothetical protein  45.69 
 
 		 344 aa  297  2e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4037  hypothetical protein  47.8 
 
 		 349 aa  295  7e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.493535  normal  0.627077 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2969  hypothetical protein  46.78 
 
 		 346 aa  294  2e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.852464  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0288  hypothetical protein  46.09 
 
 		 354 aa  291  1e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0665  hypothetical protein  44.83 
 
 		 345 aa  290  3e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0449506  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0589  hypothetical protein  45.19 
 
 		 347 aa  287  2e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.611508 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1922  hypothetical protein  44.77 
 
 		 355 aa  268  8.999999999999999e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.26263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2330  hypothetical protein  45.93 
 
 		 351 aa  266  4e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1528  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2344  hypothetical protein  34.12 
 
 		 344 aa  177  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3065  hypothetical protein  34.3 
 
 		 348 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0204721  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2469  hypothetical protein  32.94 
 
 		 344 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2216  FemAB-related protein, PEP-CTERM system- associated  32.25 
 
 		 342 aa  172  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2472  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  32.16 
 
 		 344 aa  168  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1775  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  31.39 
 
 		 344 aa  168  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2369  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  31.03 
 
 		 368 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0683  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  32.55 
 
 		 348 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0138  hypothetical protein  29.53 
 
 		 471 aa  154  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0233537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0832  hypothetical protein  26.22 
 
 		 349 aa  126  6e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00050056  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1195  hypothetical protein  23.68 
 
 		 355 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01304  hypothetical protein  29.31 
 
 		 357 aa  115  7.999999999999999e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3956  hypothetical protein  26.28 
 
 		 369 aa  91.3  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000641904 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2865  hypothetical protein  24.57 
 
 		 370 aa  91.7  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0970  hypothetical protein  23.69 
 
 		 346 aa  81.3  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.534214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1068  hypothetical protein  22.41 
 
 		 346 aa  69.3  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3193  hypothetical protein  21.43 
 
 		 346 aa  67  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2873  hypothetical protein  20.11 
 
 		 380 aa  60.8  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1113  hypothetical protein  21.36 
 
 		 335 aa  54.7  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.79737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2411  protein of unknown function DUF482  21.73 
 
 		 372 aa  55.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2728  protein of unknown function DUF482  21.48 
 
 		 360 aa  50.1  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.482238  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0715  hypothetical protein  21.55 
 
 		 321 aa  46.2  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.821886  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1138  hypothetical protein  21.32 
 
 		 324 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>