45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01304 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01304  hypothetical protein  100 
 
 		 357 aa  748    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1195  hypothetical protein  43.09 
 
 		 355 aa  298  1e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2469  hypothetical protein  39.64 
 
 		 344 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2216  FemAB-related protein, PEP-CTERM system- associated  36.69 
 
 		 342 aa  199  7e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2472  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  35.45 
 
 		 344 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0138  hypothetical protein  35.78 
 
 		 471 aa  190  4e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0233537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1775  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  34.5 
 
 		 344 aa  189  7e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3065  hypothetical protein  32.84 
 
 		 348 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0204721  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2344  hypothetical protein  33.43 
 
 		 344 aa  180  4e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0683  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  31.37 
 
 		 348 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2369  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  28.94 
 
 		 368 aa  150  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2969  hypothetical protein  27.14 
 
 		 346 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.852464  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1980  hypothetical protein  24.78 
 
 		 352 aa  136  6.0000000000000005e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3956  hypothetical protein  26.3 
 
 		 369 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000641904 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0142  hypothetical protein  26.06 
 
 		 350 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.103004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2523  hypothetical protein  27.22 
 
 		 361 aa  126  6e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.193947  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1516  hypothetical protein  24.64 
 
 		 343 aa  121  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.069659  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2511  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  25.07 
 
 		 356 aa  122  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.723604 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0832  hypothetical protein  25 
 
 		 349 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00050056  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2404  hypothetical protein  28.01 
 
 		 344 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0288  hypothetical protein  24.72 
 
 		 354 aa  113  5e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4037  hypothetical protein  24.93 
 
 		 349 aa  110  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.493535  normal  0.627077 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3113  hypothetical protein  28.67 
 
 		 345 aa  108  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0665  hypothetical protein  25.28 
 
 		 345 aa  107  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0449506  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1922  hypothetical protein  24.56 
 
 		 355 aa  107  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.26263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3275  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  25.28 
 
 		 353 aa  107  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.299337  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2330  hypothetical protein  24.7 
 
 		 351 aa  106  8e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1528  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0589  hypothetical protein  21.69 
 
 		 347 aa  103  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.611508 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0970  hypothetical protein  23.25 
 
 		 346 aa  97.8  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.534214  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3193  hypothetical protein  23.76 
 
 		 346 aa  97.4  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2865  hypothetical protein  25.25 
 
 		 370 aa  91.7  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1068  hypothetical protein  22.93 
 
 		 346 aa  88.2  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2873  hypothetical protein  23.78 
 
 		 380 aa  86.3  8e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1773  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  21.08 
 
 		 345 aa  63.9  0.000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3045  methicillin resistance protein  21.57 
 
 		 335 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0663  hypothetical protein  22.12 
 
 		 332 aa  53.9  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1444  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  24.89 
 
 		 339 aa  52  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.593499  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2169  hypothetical protein  22.33 
 
 		 360 aa  52  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.764152  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2728  protein of unknown function DUF482  21.41 
 
 		 360 aa  49.7  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.482238  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0286  Methicillin resistance protein  18.65 
 
 		 341 aa  48.5  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2342  hypothetical protein  25 
 
 		 352 aa  48.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0083  methicillin resistance protein  18.82 
 
 		 354 aa  46.6  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1739  femAB family protein  24.14 
 
 		 354 aa  46.6  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00186266  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3053  Methicillin resistance protein  19.77 
 
 		 354 aa  44.7  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000266593 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2417  methicillin resistance protein  23.15 
 
 		 366 aa  44.3  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00836283  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>