44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2728 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2728  protein of unknown function DUF482  100 
 
 
360 aa  738    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.482238  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2411  protein of unknown function DUF482  53.15 
 
 
372 aa  397  1e-109  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2501  hypothetical protein  36.28 
 
 
353 aa  228  1e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4037  hypothetical protein  25 
 
 
349 aa  73.9  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.493535  normal  0.627077 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1516  hypothetical protein  24.78 
 
 
343 aa  73.6  0.000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.069659  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2169  hypothetical protein  26.42 
 
 
360 aa  73.6  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.764152  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2511  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  23.8 
 
 
356 aa  65.1  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.723604 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2853  hypothetical protein  22.84 
 
 
348 aa  61.6  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.957178  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2344  hypothetical protein  22.32 
 
 
344 aa  60.8  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1831  hypothetical protein  23.92 
 
 
339 aa  59.7  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0138  hypothetical protein  21.45 
 
 
471 aa  58.9  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0233537  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2472  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  23.85 
 
 
344 aa  59.3  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1195  hypothetical protein  21.24 
 
 
355 aa  57  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0832  hypothetical protein  21.33 
 
 
349 aa  54.7  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00050056  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2469  hypothetical protein  22.11 
 
 
344 aa  54.3  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0142  hypothetical protein  21.8 
 
 
350 aa  53.9  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.103004  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1775  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  22.97 
 
 
344 aa  53.5  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3017  hypothetical protein  22.87 
 
 
384 aa  53.1  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1980  hypothetical protein  21.65 
 
 
352 aa  51.6  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2330  hypothetical protein  24.22 
 
 
351 aa  51.6  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1528  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0683  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  22.15 
 
 
348 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2969  hypothetical protein  23.4 
 
 
346 aa  49.7  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.852464  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01304  hypothetical protein  21.41 
 
 
357 aa  49.7  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0560  protein of unknown function DUF482  23.1 
 
 
395 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3065  hypothetical protein  23.99 
 
 
348 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0204721  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0543  protein of unknown function DUF482  23.1 
 
 
395 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01201  hypothetical protein  22.62 
 
 
390 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.640897  normal  0.481871 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2216  FemAB-related protein, PEP-CTERM system- associated  23.18 
 
 
342 aa  48.5  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2523  hypothetical protein  20.83 
 
 
361 aa  48.1  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.193947  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5671  hypothetical protein  22.98 
 
 
293 aa  47.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.597001  normal  0.0100919 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0804  hypothetical protein  22.06 
 
 
391 aa  47.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0350  hypothetical protein  23.94 
 
 
391 aa  47.8  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3275  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  21.7 
 
 
353 aa  47.4  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.299337  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0108  hypothetical protein  21.01 
 
 
384 aa  47.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.139955  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2342  hypothetical protein  21.09 
 
 
352 aa  47  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01201  hypothetical protein  21.18 
 
 
384 aa  46.6  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02101  hypothetical protein  25.23 
 
 
378 aa  46.6  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1577  protein of unknown function DUF482  21.41 
 
 
396 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.187748 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3651  hypothetical protein  23.61 
 
 
363 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2342  hypothetical protein  23.98 
 
 
391 aa  45.4  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4569  hypothetical protein  21.88 
 
 
403 aa  44.3  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1294  hypothetical protein  24.34 
 
 
393 aa  43.5  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.724983  normal  0.811045 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2369  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  21.85 
 
 
368 aa  43.5  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2634  hypothetical protein  27.33 
 
 
377 aa  43.1  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0584962  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>