58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1980 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1980  hypothetical protein  100 
 
 		 352 aa  729    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2523  hypothetical protein  60 
 
 		 361 aa  428  1e-119  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.193947  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2511  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  57.73 
 
 		 356 aa  413  1e-114  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.723604 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3275  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  57.02 
 
 		 353 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.299337  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0142  hypothetical protein  57.65 
 
 		 350 aa  403  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.103004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0288  hypothetical protein  56.65 
 
 		 354 aa  399  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1516  hypothetical protein  55.72 
 
 		 343 aa  394  1e-108  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.069659  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2404  hypothetical protein  55.99 
 
 		 344 aa  387  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0665  hypothetical protein  54.71 
 
 		 345 aa  374  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0449506  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0589  hypothetical protein  50.3 
 
 		 347 aa  342  7e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.611508 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2969  hypothetical protein  47.02 
 
 		 346 aa  309  4e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.852464  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3113  hypothetical protein  43.68 
 
 		 345 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4037  hypothetical protein  42.9 
 
 		 349 aa  270  2e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.493535  normal  0.627077 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1922  hypothetical protein  42.9 
 
 		 355 aa  261  2e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.26263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2330  hypothetical protein  44.34 
 
 		 351 aa  257  2e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1528  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2344  hypothetical protein  35.87 
 
 		 344 aa  227  3e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2469  hypothetical protein  34.65 
 
 		 344 aa  215  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1775  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  33.33 
 
 		 344 aa  212  9e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2472  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  33.63 
 
 		 344 aa  210  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2369  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  33.62 
 
 		 368 aa  204  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3065  hypothetical protein  33.72 
 
 		 348 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0204721  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0683  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  34.65 
 
 		 348 aa  199  9e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2216  FemAB-related protein, PEP-CTERM system- associated  31.58 
 
 		 342 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0138  hypothetical protein  28.27 
 
 		 471 aa  166  5e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0233537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0832  hypothetical protein  29.55 
 
 		 349 aa  158  2e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00050056  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01304  hypothetical protein  24.78 
 
 		 357 aa  136  6.0000000000000005e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1195  hypothetical protein  24.72 
 
 		 355 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3956  hypothetical protein  25.5 
 
 		 369 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000641904 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2873  hypothetical protein  27.14 
 
 		 380 aa  110  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3193  hypothetical protein  25.07 
 
 		 346 aa  103  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2865  hypothetical protein  27 
 
 		 370 aa  101  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1068  hypothetical protein  24.79 
 
 		 346 aa  100  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0970  hypothetical protein  25.86 
 
 		 346 aa  100  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.534214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3045  methicillin resistance protein  27.59 
 
 		 335 aa  70.5  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2408  methicillin resistance protein  24.76 
 
 		 363 aa  65.9  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2169  hypothetical protein  21.9 
 
 		 360 aa  60.1  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.764152  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3975  methicillin resistance protein  20.89 
 
 		 366 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2411  protein of unknown function DUF482  22.67 
 
 		 372 aa  57.8  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2417  methicillin resistance protein  24.05 
 
 		 366 aa  56.6  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00836283  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0286  Methicillin resistance protein  21.92 
 
 		 341 aa  56.2  0.0000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0663  hypothetical protein  23.03 
 
 		 332 aa  52.8  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1415  methicillin resistance protein  20.07 
 
 		 366 aa  52  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.89632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0739  methicillin resistance protein  22.59 
 
 		 368 aa  52  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.274792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2728  protein of unknown function DUF482  21.65 
 
 		 360 aa  51.6  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.482238  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1399  hypothetical protein  25.09 
 
 		 350 aa  52  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1831  hypothetical protein  19.43 
 
 		 339 aa  50.4  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4843  Methicillin resistance protein  22.6 
 
 		 360 aa  50.1  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000953777  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0719  hypothetical protein  20.22 
 
 		 333 aa  48.1  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00617075  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3053  Methicillin resistance protein  21.94 
 
 		 354 aa  47.8  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000266593 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0083  methicillin resistance protein  21.93 
 
 		 354 aa  47  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2501  hypothetical protein  19.29 
 
 		 353 aa  47.4  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2314  hypothetical protein  21.43 
 
 		 338 aa  44.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1528  hypothetical protein  22.68 
 
 		 354 aa  44.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16380  uncharacterized methicillin resistance protein  23.15 
 
 		 329 aa  44.7  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4673  methicillin resistance protein  25 
 
 		 383 aa  43.5  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0792  methicillin resistance protein  25.93 
 
 		 337 aa  43.9  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114115  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1739  femAB family protein  25.79 
 
 		 354 aa  42.7  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00186266  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3103  hypothetical protein  23.08 
 
 		 376 aa  42.7  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.73421  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>