42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0487 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0487  hypothetical protein  100 
 
 		 362 aa  743    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3651  hypothetical protein  67.13 
 
 		 363 aa  503  1e-141  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2853  hypothetical protein  29.96 
 
 		 348 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.957178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2634  hypothetical protein  31.17 
 
 		 377 aa  113  5e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0584962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2342  hypothetical protein  24.3 
 
 		 352 aa  104  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0503  hypothetical protein  22.16 
 
 		 354 aa  95.1  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.180826  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5378  GCN5-related N-acetyltransferase  29.64 
 
 		 363 aa  93.2  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3308  hypothetical protein  32.24 
 
 		 353 aa  90.9  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2330  hypothetical protein  28.42 
 
 		 335 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.210198 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1528  hypothetical protein  26.69 
 
 		 354 aa  78.2  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2976  hypothetical protein  26.07 
 
 		 329 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3120  hypothetical protein  26.07 
 
 		 329 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00669  hypothetical protein  25.93 
 
 		 331 aa  73.9  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2417  methicillin resistance protein  29.1 
 
 		 366 aa  67.8  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00836283  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4854  hypothetical protein  25.83 
 
 		 355 aa  62  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1444  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  27.85 
 
 		 339 aa  60.8  0.00000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.593499  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3045  methicillin resistance protein  28.19 
 
 		 335 aa  59.3  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3975  methicillin resistance protein  29.52 
 
 		 366 aa  57  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1739  femAB family protein  26.7 
 
 		 354 aa  56.6  0.0000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00186266  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1611  Methicillin resistance protein  23.3 
 
 		 370 aa  56.2  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1773  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  30.82 
 
 		 345 aa  56.2  0.0000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2169  hypothetical protein  25.35 
 
 		 360 aa  54.7  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.764152  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1247  femAB family protein  25 
 
 		 352 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4843  Methicillin resistance protein  25.27 
 
 		 360 aa  52.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000953777  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2408  methicillin resistance protein  26.32 
 
 		 363 aa  52.4  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0083  methicillin resistance protein  29.92 
 
 		 354 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8162  Methicillin resistance protein  26.49 
 
 		 343 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848631  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2873  hypothetical protein  26.95 
 
 		 380 aa  51.2  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0275  hypothetical protein  25.62 
 
 		 350 aa  50.8  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2858  methicillin resistance protein  30.99 
 
 		 342 aa  50.1  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0390  hypothetical protein  22.64 
 
 		 342 aa  47.8  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1415  methicillin resistance protein  27.75 
 
 		 366 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.89632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5671  hypothetical protein  27.1 
 
 		 293 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.597001  normal  0.0100919 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0340  Methicillin resistance protein  32.17 
 
 		 394 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0970  hypothetical protein  24.43 
 
 		 346 aa  44.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.534214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0663  hypothetical protein  26.35 
 
 		 332 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2852  hypothetical protein  23.9 
 
 		 293 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000023268 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1138  hypothetical protein  23.75 
 
 		 324 aa  43.9  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1516  hypothetical protein  24.84 
 
 		 343 aa  44.3  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.069659  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2411  protein of unknown function DUF482  20.64 
 
 		 372 aa  43.5  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3053  Methicillin resistance protein  29.19 
 
 		 354 aa  43.1  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000266593 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0792  methicillin resistance protein  25.99 
 
 		 337 aa  42.7  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>