16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4854 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4854  hypothetical protein  100 
 
 
355 aa  716    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2330  hypothetical protein  26.32 
 
 
335 aa  105  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.210198 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00669  hypothetical protein  27.76 
 
 
331 aa  104  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2853  hypothetical protein  22.62 
 
 
348 aa  91.3  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.957178  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2976  hypothetical protein  27.11 
 
 
329 aa  90.1  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3120  hypothetical protein  27.11 
 
 
329 aa  90.1  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2342  hypothetical protein  22 
 
 
352 aa  84.3  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5378  GCN5-related N-acetyltransferase  27.37 
 
 
363 aa  73.6  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1528  hypothetical protein  25.93 
 
 
354 aa  71.6  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2634  hypothetical protein  25.26 
 
 
377 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0584962  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0390  hypothetical protein  20.81 
 
 
342 aa  66.2  0.0000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0487  hypothetical protein  25.83 
 
 
362 aa  62  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0503  hypothetical protein  21.74 
 
 
354 aa  60.5  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.180826  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3308  hypothetical protein  25.77 
 
 
353 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2408  methicillin resistance protein  23.33 
 
 
363 aa  43.1  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0885  Methicillin resistance protein  28.81 
 
 
357 aa  42.7  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>