42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2853 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_2853  hypothetical protein  100 
 
 
348 aa  723    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.957178  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2634  hypothetical protein  31.28 
 
 
377 aa  186  8e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0584962  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2342  hypothetical protein  29.3 
 
 
352 aa  171  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0503  hypothetical protein  30.67 
 
 
354 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.180826  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3651  hypothetical protein  30.51 
 
 
363 aa  135  9e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00669  hypothetical protein  33.1 
 
 
331 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0487  hypothetical protein  29.96 
 
 
362 aa  124  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2330  hypothetical protein  30.3 
 
 
335 aa  122  7e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.210198 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5378  GCN5-related N-acetyltransferase  29.06 
 
 
363 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3120  hypothetical protein  31.11 
 
 
329 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2976  hypothetical protein  31.11 
 
 
329 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3308  hypothetical protein  30.1 
 
 
353 aa  116  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1528  hypothetical protein  26 
 
 
354 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0275  hypothetical protein  25.78 
 
 
350 aa  98.2  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4854  hypothetical protein  22.62 
 
 
355 aa  91.3  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0390  hypothetical protein  25.26 
 
 
342 aa  80.5  0.00000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2728  protein of unknown function DUF482  22.84 
 
 
360 aa  61.6  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.482238  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2411  protein of unknown function DUF482  21.18 
 
 
372 aa  58.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8162  Methicillin resistance protein  29.05 
 
 
343 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848631  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0286  Methicillin resistance protein  22.95 
 
 
341 aa  57.4  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2216  FemAB-related protein, PEP-CTERM system- associated  26.11 
 
 
342 aa  57  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2344  hypothetical protein  21.21 
 
 
344 aa  55.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3975  methicillin resistance protein  23.97 
 
 
366 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1611  Methicillin resistance protein  22.16 
 
 
370 aa  53.9  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3045  methicillin resistance protein  25.44 
 
 
335 aa  52.8  0.000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4843  Methicillin resistance protein  25.6 
 
 
360 aa  51.6  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000953777  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2472  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  23.39 
 
 
344 aa  51.6  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2169  hypothetical protein  22.29 
 
 
360 aa  51.6  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.764152  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2417  methicillin resistance protein  25.26 
 
 
366 aa  50.4  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00836283  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3193  hypothetical protein  26.02 
 
 
346 aa  50.4  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1415  methicillin resistance protein  22.47 
 
 
366 aa  49.7  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.89632  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0663  hypothetical protein  22.44 
 
 
332 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16380  uncharacterized methicillin resistance protein  23.75 
 
 
329 aa  48.9  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1138  hypothetical protein  27.15 
 
 
324 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1775  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  22.81 
 
 
344 aa  46.6  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3053  Methicillin resistance protein  24.75 
 
 
354 aa  46.2  0.0009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000266593 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4739  hypothetical protein  20.65 
 
 
334 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.08244  hitchhiker  0.000638889 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2093  Methicillin resistance protein  24.71 
 
 
346 aa  45.4  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.801885  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1068  hypothetical protein  24.6 
 
 
346 aa  45.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5671  hypothetical protein  22.52 
 
 
293 aa  45.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.597001  normal  0.0100919 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2469  hypothetical protein  21.91 
 
 
344 aa  44.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0190  hypothetical protein  23.94 
 
 
379 aa  42.7  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>