30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1528 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1528  hypothetical protein  100 
 
 		 354 aa  728    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5378  GCN5-related N-acetyltransferase  39.66 
 
 		 363 aa  233  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0275  hypothetical protein  43.02 
 
 		 350 aa  229  4e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3308  hypothetical protein  37.32 
 
 		 353 aa  202  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2342  hypothetical protein  26.78 
 
 		 352 aa  138  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2853  hypothetical protein  26.29 
 
 		 348 aa  122  7e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.957178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2634  hypothetical protein  29.78 
 
 		 377 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0584962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3120  hypothetical protein  28.4 
 
 		 329 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2976  hypothetical protein  28.4 
 
 		 329 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3651  hypothetical protein  27.98 
 
 		 363 aa  94.4  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00669  hypothetical protein  27.36 
 
 		 331 aa  92.4  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0503  hypothetical protein  24.03 
 
 		 354 aa  89.4  9e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.180826  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0487  hypothetical protein  27.27 
 
 		 362 aa  89  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2330  hypothetical protein  26.78 
 
 		 335 aa  88.6  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.210198 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4854  hypothetical protein  26.23 
 
 		 355 aa  79  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0390  hypothetical protein  23.31 
 
 		 342 aa  72.8  0.000000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4739  hypothetical protein  22.71 
 
 		 334 aa  60.1  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.08244  hitchhiker  0.000638889 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2411  protein of unknown function DUF482  27.06 
 
 		 372 aa  50.8  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2093  Methicillin resistance protein  26.5 
 
 		 346 aa  50.1  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.801885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1294  Methicillin resistance protein  25.7 
 
 		 340 aa  49.3  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.402759 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2344  hypothetical protein  23.53 
 
 		 344 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2728  protein of unknown function DUF482  26.45 
 
 		 360 aa  48.1  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.482238  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2216  FemAB-related protein, PEP-CTERM system- associated  26.19 
 
 		 342 aa  47.8  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0832  hypothetical protein  21.34 
 
 		 349 aa  47.4  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00050056  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1980  hypothetical protein  22.68 
 
 		 352 aa  46.6  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2469  hypothetical protein  22.99 
 
 		 344 aa  46.2  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0683  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  24.28 
 
 		 348 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3065  hypothetical protein  24.09 
 
 		 348 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0204721  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2472  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  24.43 
 
 		 344 aa  43.9  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1138  hypothetical protein  21.59 
 
 		 324 aa  43.5  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>