22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0503 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0503  hypothetical protein  100 
 
 
354 aa  714    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.180826  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2342  hypothetical protein  33.06 
 
 
352 aa  155  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2853  hypothetical protein  30.67 
 
 
348 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.957178  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00669  hypothetical protein  29.08 
 
 
331 aa  108  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2330  hypothetical protein  30.9 
 
 
335 aa  106  5e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.210198 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0390  hypothetical protein  29.88 
 
 
342 aa  95.9  9e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0487  hypothetical protein  22.16 
 
 
362 aa  95.1  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3120  hypothetical protein  28.17 
 
 
329 aa  90.1  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2976  hypothetical protein  28.17 
 
 
329 aa  90.1  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5378  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
363 aa  87.4  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3651  hypothetical protein  20.18 
 
 
363 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1528  hypothetical protein  23.48 
 
 
354 aa  78.2  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2634  hypothetical protein  21.28 
 
 
377 aa  76.6  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0584962  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3308  hypothetical protein  23.93 
 
 
353 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0275  hypothetical protein  21.69 
 
 
350 aa  63.5  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4854  hypothetical protein  21.74 
 
 
355 aa  60.5  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1247  femAB family protein  25.91 
 
 
352 aa  57  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0190  hypothetical protein  25 
 
 
379 aa  56.2  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1444  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  29.1 
 
 
339 aa  50.4  0.00005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.593499  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2357  hypothetical protein  23.41 
 
 
297 aa  48.9  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16380  uncharacterized methicillin resistance protein  17.48 
 
 
329 aa  44.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2216  FemAB-related protein, PEP-CTERM system- associated  24.31 
 
 
342 aa  43.1  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>