22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0275 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0275  hypothetical protein  100 
 
 		 350 aa  687    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1528  hypothetical protein  43.02 
 
 		 354 aa  243  3e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5378  GCN5-related N-acetyltransferase  35.98 
 
 		 363 aa  196  7e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3308  hypothetical protein  34.51 
 
 		 353 aa  152  8.999999999999999e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2342  hypothetical protein  25.07 
 
 		 352 aa  140  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2853  hypothetical protein  26.35 
 
 		 348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.957178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2634  hypothetical protein  32.24 
 
 		 377 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0584962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0503  hypothetical protein  22.56 
 
 		 354 aa  83.6  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.180826  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3651  hypothetical protein  30.17 
 
 		 363 aa  83.6  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2976  hypothetical protein  30.8 
 
 		 329 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3120  hypothetical protein  30.8 
 
 		 329 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00669  hypothetical protein  27.99 
 
 		 331 aa  80.9  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2330  hypothetical protein  29.18 
 
 		 335 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.210198 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4739  hypothetical protein  23.21 
 
 		 334 aa  71.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.08244  hitchhiker  0.000638889 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0487  hypothetical protein  25.62 
 
 		 362 aa  63.9  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0390  hypothetical protein  23.1 
 
 		 342 aa  62  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3065  hypothetical protein  31.13 
 
 		 348 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0204721  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2369  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  25.45 
 
 		 368 aa  48.9  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2216  FemAB-related protein, PEP-CTERM system- associated  25 
 
 		 342 aa  48.9  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0683  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  29.36 
 
 		 348 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1294  Methicillin resistance protein  23.78 
 
 		 340 aa  45.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.402759 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2093  Methicillin resistance protein  22.62 
 
 		 346 aa  43.9  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.801885  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>