49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2342 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2342  hypothetical protein  100 
 
 		 352 aa  721    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2853  hypothetical protein  29.3 
 
 		 348 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.957178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0503  hypothetical protein  33.06 
 
 		 354 aa  155  1e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.180826  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3308  hypothetical protein  28.27 
 
 		 353 aa  152  7e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5378  GCN5-related N-acetyltransferase  30.06 
 
 		 363 aa  152  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1528  hypothetical protein  26.78 
 
 		 354 aa  122  8e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3651  hypothetical protein  24.65 
 
 		 363 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2634  hypothetical protein  26.16 
 
 		 377 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0584962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0275  hypothetical protein  25.07 
 
 		 350 aa  113  6e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00669  hypothetical protein  29.03 
 
 		 331 aa  109  7.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3120  hypothetical protein  28.38 
 
 		 329 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2976  hypothetical protein  28.38 
 
 		 329 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0487  hypothetical protein  24.3 
 
 		 362 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2330  hypothetical protein  28.83 
 
 		 335 aa  103  5e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.210198 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4854  hypothetical protein  22 
 
 		 355 aa  84.3  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0390  hypothetical protein  28.2 
 
 		 342 aa  84.3  0.000000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4739  hypothetical protein  25.32 
 
 		 334 aa  74.7  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.08244  hitchhiker  0.000638889 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2469  hypothetical protein  26.91 
 
 		 344 aa  71.2  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2216  FemAB-related protein, PEP-CTERM system- associated  26.42 
 
 		 342 aa  68.9  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2344  hypothetical protein  25.25 
 
 		 344 aa  64.7  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2501  hypothetical protein  23.85 
 
 		 353 aa  63.9  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1775  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  26.24 
 
 		 344 aa  63.5  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2472  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  27.89 
 
 		 344 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1739  femAB family protein  24.4 
 
 		 354 aa  60.1  0.00000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00186266  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1444  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  27.37 
 
 		 339 aa  58.5  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.593499  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2852  hypothetical protein  31.03 
 
 		 293 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000023268 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2417  methicillin resistance protein  25.31 
 
 		 366 aa  55.5  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00836283  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0832  hypothetical protein  26.11 
 
 		 349 aa  55.1  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00050056  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5671  hypothetical protein  28.99 
 
 		 293 aa  53.5  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.597001  normal  0.0100919 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1611  Methicillin resistance protein  25.65 
 
 		 370 aa  51.2  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3065  hypothetical protein  23.42 
 
 		 348 aa  50.4  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0204721  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0683  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  23.35 
 
 		 348 aa  50.1  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2873  hypothetical protein  26.67 
 
 		 380 aa  50.1  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0663  hypothetical protein  23.93 
 
 		 332 aa  50.1  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0286  Methicillin resistance protein  22.36 
 
 		 341 aa  49.7  0.00007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2411  protein of unknown function DUF482  22.85 
 
 		 372 aa  49.7  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4843  Methicillin resistance protein  29.8 
 
 		 360 aa  48.5  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000953777  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3045  methicillin resistance protein  22.46 
 
 		 335 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01304  hypothetical protein  25 
 
 		 357 aa  48.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2369  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  26.7 
 
 		 368 aa  47.4  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2114  hypothetical protein  26.6 
 
 		 391 aa  47.4  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0393548 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2728  protein of unknown function DUF482  21.09 
 
 		 360 aa  47  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.482238  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1138  hypothetical protein  26.32 
 
 		 324 aa  46.6  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2357  hypothetical protein  25.52 
 
 		 297 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1773  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  24.44 
 
 		 345 aa  45.8  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1187  hypothetical protein  23.88 
 
 		 391 aa  44.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.225085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2408  methicillin resistance protein  24.38 
 
 		 363 aa  43.1  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8162  Methicillin resistance protein  23.75 
 
 		 343 aa  43.1  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848631  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2093  Methicillin resistance protein  22.5 
 
 		 346 aa  42.7  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.801885  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>