16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2357 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2357  hypothetical protein  100 
 
 
297 aa  619  1e-176  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0390  hypothetical protein  23.29 
 
 
342 aa  66.2  0.0000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5378  GCN5-related N-acetyltransferase  28.99 
 
 
363 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2342  hypothetical protein  26.04 
 
 
352 aa  58.5  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0503  hypothetical protein  23.9 
 
 
354 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.180826  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00669  hypothetical protein  23.04 
 
 
331 aa  55.8  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0190  hypothetical protein  29.24 
 
 
379 aa  49.3  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0922  hypothetical protein  34.41 
 
 
307 aa  48.5  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3584  hypothetical protein  27.49 
 
 
366 aa  48.1  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3417  putative FemAB family protein  34.04 
 
 
328 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.658974  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3683  FemAB family protein  34.04 
 
 
328 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.830414  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2853  hypothetical protein  23.56 
 
 
348 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.957178  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2976  hypothetical protein  24.62 
 
 
329 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3120  hypothetical protein  24.62 
 
 
329 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3308  hypothetical protein  28.57 
 
 
353 aa  42.7  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1528  hypothetical protein  28.04 
 
 
354 aa  42.7  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>