22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0922 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0922  hypothetical protein  100 
 
 		 307 aa  608  1e-173  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3683  FemAB family protein  39.33 
 
 		 328 aa  153  4e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.830414  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3417  putative FemAB family protein  38.54 
 
 		 328 aa  152  8e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.658974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1791  hypothetical protein  36.95 
 
 		 305 aa  139  7e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.344205 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0062  putative FemAB family protein  38.19 
 
 		 323 aa  125  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.731343 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4843  Methicillin resistance protein  28.26 
 
 		 360 aa  55.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000953777  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1611  Methicillin resistance protein  27.96 
 
 		 370 aa  53.9  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2873  hypothetical protein  37.97 
 
 		 380 aa  53.1  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1598  Methicillin resistance protein  22.04 
 
 		 364 aa  52.8  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.075491  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2408  methicillin resistance protein  26.34 
 
 		 363 aa  52  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3193  hypothetical protein  35.16 
 
 		 346 aa  49.7  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1068  hypothetical protein  36.14 
 
 		 346 aa  47.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0340  Methicillin resistance protein  28.48 
 
 		 394 aa  47.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0885  Methicillin resistance protein  24.18 
 
 		 357 aa  45.8  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0961  methicillin resistance protein  25.91 
 
 		 359 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1138  hypothetical protein  35.56 
 
 		 324 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2417  methicillin resistance protein  23.68 
 
 		 366 aa  43.9  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00836283  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4293  hypothetical protein  24.38 
 
 		 334 aa  43.5  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0525491 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3956  hypothetical protein  25.83 
 
 		 369 aa  42.7  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000641904 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0801  Methicillin resistance protein  24.48 
 
 		 373 aa  42.7  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3925  hypothetical protein  24.38 
 
 		 334 aa  42.7  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.117767  normal  0.0555776 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4673  methicillin resistance protein  27.46 
 
 		 383 aa  42.7  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>