31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0062 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0062  putative FemAB family protein  100 
 
 		 323 aa  648    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.731343 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3683  FemAB family protein  36.54 
 
 		 328 aa  145  6e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.830414  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3417  putative FemAB family protein  35.88 
 
 		 328 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.658974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0922  hypothetical protein  38.19 
 
 		 307 aa  125  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1791  hypothetical protein  29.29 
 
 		 305 aa  102  7e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.344205 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1611  Methicillin resistance protein  22.29 
 
 		 370 aa  64.7  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1294  Methicillin resistance protein  25.51 
 
 		 340 aa  62.8  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.402759 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5045  hypothetical protein  25.25 
 
 		 332 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.280998  normal  0.420218 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2093  Methicillin resistance protein  25.85 
 
 		 346 aa  60.8  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.801885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4584  hypothetical protein  24.92 
 
 		 332 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.91512 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2858  methicillin resistance protein  25.73 
 
 		 342 aa  59.3  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0961  hypothetical protein  24.53 
 
 		 372 aa  59.3  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.605405  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1739  femAB family protein  23.15 
 
 		 354 aa  58.2  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00186266  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4293  hypothetical protein  26.58 
 
 		 334 aa  56.2  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0525491 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5355  hypothetical protein  27.13 
 
 		 359 aa  55.8  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0746954 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3925  hypothetical protein  26.58 
 
 		 334 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.117767  normal  0.0555776 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16380  uncharacterized methicillin resistance protein  22.36 
 
 		 329 aa  53.1  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4843  Methicillin resistance protein  27.71 
 
 		 360 aa  52.8  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000953777  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1247  femAB family protein  26.74 
 
 		 352 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0739  methicillin resistance protein  25.08 
 
 		 368 aa  48.5  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.274792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4359  hypothetical protein  27.62 
 
 		 333 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651926  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0340  Methicillin resistance protein  28.09 
 
 		 394 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1598  Methicillin resistance protein  26.46 
 
 		 364 aa  48.1  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.075491  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2344  hypothetical protein  28.42 
 
 		 344 aa  47.8  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2408  methicillin resistance protein  25 
 
 		 363 aa  47.8  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1609  Methicillin resistance protein  23.26 
 
 		 347 aa  46.6  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4673  methicillin resistance protein  27.06 
 
 		 383 aa  44.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0885  Methicillin resistance protein  25.62 
 
 		 357 aa  44.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3045  methicillin resistance protein  27.93 
 
 		 335 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5796  Methicillin resistance protein  28.74 
 
 		 370 aa  43.9  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0083  methicillin resistance protein  24.26 
 
 		 354 aa  42.4  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>