15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3683 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3683  FemAB family protein  100 
 
 		 328 aa  632  1e-180  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.830414  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3417  putative FemAB family protein  96.65 
 
 		 328 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.658974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0922  hypothetical protein  39.33 
 
 		 307 aa  153  4e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0062  putative FemAB family protein  36.54 
 
 		 323 aa  145  6e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.731343 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1791  hypothetical protein  30.98 
 
 		 305 aa  97.8  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.344205 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5355  hypothetical protein  28.24 
 
 		 359 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0746954 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2408  methicillin resistance protein  25.9 
 
 		 363 aa  51.2  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4293  hypothetical protein  25.09 
 
 		 334 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0525491 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16380  uncharacterized methicillin resistance protein  25.46 
 
 		 329 aa  51.6  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3925  hypothetical protein  25.09 
 
 		 334 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.117767  normal  0.0555776 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5045  hypothetical protein  28.35 
 
 		 332 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.280998  normal  0.420218 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4584  hypothetical protein  27.07 
 
 		 332 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.91512 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4843  Methicillin resistance protein  22.79 
 
 		 360 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000953777  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1611  Methicillin resistance protein  22.01 
 
 		 370 aa  45.8  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0771  methicillin resistance protein  23.58 
 
 		 377 aa  42.7  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.455727  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>