23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5355 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5355  hypothetical protein  100 
 
 
359 aa  723    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0746954 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4359  hypothetical protein  63.06 
 
 
333 aa  402  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651926  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4293  hypothetical protein  53.01 
 
 
334 aa  349  3e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0525491 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3925  hypothetical protein  53.01 
 
 
334 aa  349  3e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.117767  normal  0.0555776 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5045  hypothetical protein  54.24 
 
 
332 aa  346  3e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.280998  normal  0.420218 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4584  hypothetical protein  53.94 
 
 
332 aa  344  1e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.91512 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0961  hypothetical protein  27.2 
 
 
372 aa  67.4  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.605405  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1247  femAB family protein  26.2 
 
 
352 aa  59.7  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0062  putative FemAB family protein  27.13 
 
 
323 aa  55.8  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.731343 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0340  Methicillin resistance protein  28.64 
 
 
394 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0083  methicillin resistance protein  24.43 
 
 
354 aa  53.1  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3053  Methicillin resistance protein  26.98 
 
 
354 aa  53.5  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000266593 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3683  FemAB family protein  28.24 
 
 
328 aa  52.8  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.830414  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2408  methicillin resistance protein  26.16 
 
 
363 aa  51.6  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8162  Methicillin resistance protein  27.61 
 
 
343 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848631  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3417  putative FemAB family protein  27.78 
 
 
328 aa  49.7  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.658974  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3975  methicillin resistance protein  26.9 
 
 
366 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2472  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  27.36 
 
 
344 aa  48.9  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2417  methicillin resistance protein  23.56 
 
 
366 aa  47.8  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00836283  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1611  Methicillin resistance protein  22.36 
 
 
370 aa  47  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2858  methicillin resistance protein  23.62 
 
 
342 aa  46.6  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1393  hypothetical protein  25 
 
 
331 aa  44.7  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.238447  normal  0.393853 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1415  methicillin resistance protein  24.57 
 
 
366 aa  43.9  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.89632  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>