65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2858 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2858  methicillin resistance protein  100 
 
 
342 aa  693    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2408  methicillin resistance protein  31.5 
 
 
363 aa  163  4.0000000000000004e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4843  Methicillin resistance protein  30.5 
 
 
360 aa  154  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000953777  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1611  Methicillin resistance protein  29.97 
 
 
370 aa  152  7e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0801  Methicillin resistance protein  38.97 
 
 
373 aa  142  8e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2417  methicillin resistance protein  28 
 
 
366 aa  132  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00836283  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3053  Methicillin resistance protein  28.99 
 
 
354 aa  127  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000266593 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0083  methicillin resistance protein  30.65 
 
 
354 aa  126  6e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8162  Methicillin resistance protein  30.29 
 
 
343 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848631  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1247  femAB family protein  34.38 
 
 
352 aa  124  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0599  FemA protein  30.35 
 
 
347 aa  117  1.9999999999999998e-25  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.33847  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3975  methicillin resistance protein  30.37 
 
 
366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1598  Methicillin resistance protein  34.91 
 
 
364 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.075491  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1739  femAB family protein  24.93 
 
 
354 aa  114  2.0000000000000002e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00186266  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1609  Methicillin resistance protein  26.71 
 
 
347 aa  110  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0961  methicillin resistance protein  33.48 
 
 
359 aa  105  9e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1415  methicillin resistance protein  29.91 
 
 
366 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.89632  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1294  Methicillin resistance protein  28.83 
 
 
340 aa  97.1  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.402759 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2093  Methicillin resistance protein  28.12 
 
 
346 aa  96.3  6e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.801885  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0792  methicillin resistance protein  28.57 
 
 
337 aa  95.9  8e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114115  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0771  methicillin resistance protein  27.52 
 
 
377 aa  95.1  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.455727  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1185  methicillin resistance protein  28.57 
 
 
315 aa  94.7  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.192582  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5796  Methicillin resistance protein  33.53 
 
 
370 aa  94.4  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1256  Methicillin resistance protein  27.95 
 
 
347 aa  84.3  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000274445 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0885  Methicillin resistance protein  25.59 
 
 
357 aa  83.6  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0340  Methicillin resistance protein  30.86 
 
 
394 aa  83.2  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0286  Methicillin resistance protein  26.25 
 
 
341 aa  82  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4673  methicillin resistance protein  26.33 
 
 
383 aa  79  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16380  uncharacterized methicillin resistance protein  24.75 
 
 
329 aa  78.6  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2928  Methicillin resistance protein  39.18 
 
 
410 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.651446 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2059  FemAB family protein  37.23 
 
 
445 aa  73.9  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2347  FemAB family protein  37.23 
 
 
445 aa  73.9  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.439209  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1393  hypothetical protein  24.92 
 
 
331 aa  67  0.0000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.238447  normal  0.393853 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0970  hypothetical protein  26.9 
 
 
346 aa  66.6  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.534214  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1773  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  23.25 
 
 
345 aa  65.5  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0190  hypothetical protein  28.24 
 
 
379 aa  62  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3584  hypothetical protein  26.6 
 
 
366 aa  61.6  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0220  hypothetical protein  24.02 
 
 
331 aa  60.8  0.00000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.186583  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1844  femX protein  21.61 
 
 
416 aa  60.1  0.00000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.700473  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0062  putative FemAB family protein  25.73 
 
 
323 aa  59.3  0.00000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.731343 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04920  predicted ATP-grasp enzyme  24.83 
 
 
753 aa  58.2  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3193  hypothetical protein  24.58 
 
 
346 aa  56.6  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2865  hypothetical protein  20.19 
 
 
370 aa  56.2  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3045  methicillin resistance protein  23.48 
 
 
335 aa  56.2  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1068  hypothetical protein  25 
 
 
346 aa  54.7  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2329  methicillin resistance protein  30 
 
 
421 aa  54.3  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.179607  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2288  methicillin resistance protein  30 
 
 
421 aa  54.3  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00915844  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1444  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  23.25 
 
 
339 aa  53.1  0.000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.593499  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2169  hypothetical protein  26.04 
 
 
360 aa  53.5  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.764152  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2873  hypothetical protein  22.95 
 
 
380 aa  52.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0739  methicillin resistance protein  25.1 
 
 
368 aa  50.4  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.274792  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0886  Methicillin resistance protein  24.7 
 
 
437 aa  50.1  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0487  hypothetical protein  30.99 
 
 
362 aa  50.1  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0961  hypothetical protein  24.03 
 
 
372 aa  49.3  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.605405  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4584  hypothetical protein  25.87 
 
 
332 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.91512 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0946  femA protein  32.88 
 
 
417 aa  47.4  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.70677  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1435  methicillin resistance protein  32.43 
 
 
420 aa  47  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.452442  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1464  methicillin resistance protein  32.43 
 
 
420 aa  47  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.297112  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5355  hypothetical protein  23.62 
 
 
359 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0746954 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5045  hypothetical protein  25.55 
 
 
332 aa  45.8  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.280998  normal  0.420218 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5378  GCN5-related N-acetyltransferase  28.68 
 
 
363 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4293  hypothetical protein  25.7 
 
 
334 aa  44.3  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0525491 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3925  hypothetical protein  25.39 
 
 
334 aa  43.1  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.117767  normal  0.0555776 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0947  femB protein  22.4 
 
 
417 aa  43.1  0.007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.453149  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2344  hypothetical protein  26.11 
 
 
344 aa  42.7  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>