59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_16380 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_16380  uncharacterized methicillin resistance protein  100 
 
 
329 aa  671    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1393  hypothetical protein  54.52 
 
 
331 aa  349  4e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.238447  normal  0.393853 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1256  Methicillin resistance protein  47.85 
 
 
347 aa  306  3e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000274445 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1611  Methicillin resistance protein  29.51 
 
 
370 aa  124  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1609  Methicillin resistance protein  30.45 
 
 
347 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2408  methicillin resistance protein  29.18 
 
 
363 aa  121  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2417  methicillin resistance protein  28.61 
 
 
366 aa  121  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00836283  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4843  Methicillin resistance protein  28.53 
 
 
360 aa  117  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000953777  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0792  methicillin resistance protein  29.39 
 
 
337 aa  109  7.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114115  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3053  Methicillin resistance protein  32.61 
 
 
354 aa  107  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000266593 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0083  methicillin resistance protein  28.57 
 
 
354 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3975  methicillin resistance protein  31.01 
 
 
366 aa  100  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1415  methicillin resistance protein  31.07 
 
 
366 aa  99.8  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.89632  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0739  methicillin resistance protein  27.84 
 
 
368 aa  85.9  8e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.274792  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1739  femAB family protein  20.55 
 
 
354 aa  84  0.000000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00186266  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2093  Methicillin resistance protein  25.84 
 
 
346 aa  82.4  0.000000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.801885  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2858  methicillin resistance protein  24.75 
 
 
342 aa  80.9  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0286  Methicillin resistance protein  24.83 
 
 
341 aa  78.2  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1294  Methicillin resistance protein  25.38 
 
 
340 aa  75.1  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.402759 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0771  methicillin resistance protein  26.39 
 
 
377 aa  74.3  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.455727  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1185  methicillin resistance protein  29.44 
 
 
315 aa  73.6  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.192582  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8162  Methicillin resistance protein  24.62 
 
 
343 aa  73.2  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848631  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0801  Methicillin resistance protein  23.95 
 
 
373 aa  72  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0885  Methicillin resistance protein  26.73 
 
 
357 aa  70.5  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1844  femX protein  24.76 
 
 
416 aa  67  0.0000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.700473  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1247  femAB family protein  27.72 
 
 
352 aa  67  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4673  methicillin resistance protein  25.78 
 
 
383 aa  64.3  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0220  hypothetical protein  25.97 
 
 
331 aa  64.3  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.186583  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3045  methicillin resistance protein  26.1 
 
 
335 aa  63.9  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2288  methicillin resistance protein  24.9 
 
 
421 aa  63.2  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00915844  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2329  methicillin resistance protein  24.9 
 
 
421 aa  63.2  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.179607  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0961  hypothetical protein  24.11 
 
 
372 aa  61.2  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.605405  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1112  peptidoglycan branched peptide synthesis protein  21.34 
 
 
404 aa  58.9  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1598  Methicillin resistance protein  23.2 
 
 
364 aa  58.5  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.075491  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0062  putative FemAB family protein  22.71 
 
 
323 aa  56.2  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.731343 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0190  hypothetical protein  21.59 
 
 
379 aa  55.5  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3683  FemAB family protein  26.09 
 
 
328 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.830414  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0961  methicillin resistance protein  26.63 
 
 
359 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3417  putative FemAB family protein  25.93 
 
 
328 aa  49.7  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.658974  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1773  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  23.29 
 
 
345 aa  49.7  0.00008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2853  hypothetical protein  24.39 
 
 
348 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.957178  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3193  hypothetical protein  24.22 
 
 
346 aa  48.5  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3044  hypothetical protein  27.71 
 
 
340 aa  48.9  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0882  hypothetical protein  26.86 
 
 
309 aa  48.9  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.92764 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0599  FemA protein  21.03 
 
 
347 aa  48.9  0.0001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.33847  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2347  FemAB family protein  24.32 
 
 
445 aa  48.1  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.439209  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04920  predicted ATP-grasp enzyme  25.81 
 
 
753 aa  47.8  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2059  FemAB family protein  24.32 
 
 
445 aa  48.1  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3584  hypothetical protein  23.13 
 
 
366 aa  47.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0663  hypothetical protein  24.38 
 
 
332 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1980  hypothetical protein  23.15 
 
 
352 aa  47.8  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5796  Methicillin resistance protein  23.05 
 
 
370 aa  47  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1068  hypothetical protein  23.83 
 
 
346 aa  46.6  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0970  hypothetical protein  23.08 
 
 
346 aa  45.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.534214  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3651  hypothetical protein  25.45 
 
 
363 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0503  hypothetical protein  18.91 
 
 
354 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.180826  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2928  Methicillin resistance protein  28.06 
 
 
410 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.651446 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5355  hypothetical protein  25.57 
 
 
359 aa  43.5  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0746954 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2511  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  24.85 
 
 
356 aa  43.5  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.723604 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>