102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_04920 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_04920  predicted ATP-grasp enzyme  100 
 
 		 753 aa  1558    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0220  hypothetical protein  47.59 
 
 		 331 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.186583  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16420  predicted ATP-grasp enzyme  38.01 
 
 		 415 aa  276  1.0000000000000001e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06110  predicted ATP-grasp enzyme  37.26 
 
 		 421 aa  262  2e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12240  predicted ATP-grasp enzyme  35.38 
 
 		 424 aa  248  4e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.589336  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1888  protein of unknown function DUF201  36.63 
 
 		 441 aa  241  4e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.205911  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1390  putative ATP-grasp protein  35.35 
 
 		 413 aa  236  1.0000000000000001e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00627885  normal  0.224685 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1887  ATP-grasp protein-like protein  34.38 
 
 		 426 aa  226  1e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.615046  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1730  ATP-grasp protein-like protein  35.27 
 
 		 418 aa  222  1.9999999999999999e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.171571  normal  0.118252 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12250  predicted ATP-grasp enzyme  30.96 
 
 		 419 aa  192  2e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.206907  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1966  ATP-grasp protein  31.81 
 
 		 443 aa  190  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.151473  hitchhiker  0.0000495401 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2122  ATP-grasp protein-like protein  30.15 
 
 		 428 aa  187  6e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.598506  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1936  ATP-grasp protein-like protein  28.54 
 
 		 414 aa  156  2e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2532  hypothetical protein  26.78 
 
 		 408 aa  152  2e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0466  hypothetical protein  29.81 
 
 		 413 aa  144  7e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0136  ATP-grasp protein  25.5 
 
 		 443 aa  139  2e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000567708  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1663  putative ATP-grasp protein  27.27 
 
 		 391 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0312334  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2881  ATP-grasp protein-like protein  23.27 
 
 		 399 aa  73.6  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000202032  hitchhiker  0.00373255 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0958  ATP-grasp enzyme-like  26.91 
 
 		 385 aa  72.8  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1247  femAB family protein  25.48 
 
 		 352 aa  65.9  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2335  hypothetical protein  28.68 
 
 		 404 aa  66.6  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0630  hypothetical protein  26.32 
 
 		 408 aa  65.1  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4673  methicillin resistance protein  26.06 
 
 		 383 aa  63.9  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0599  FemA protein  20.72 
 
 		 347 aa  63.2  0.00000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.33847  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2168  ATP-grasp enzyme-like protein  20.59 
 
 		 411 aa  61.2  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.862248  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0189  hypothetical protein  23.03 
 
 		 391 aa  60.8  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6401  hypothetical protein  22.9 
 
 		 418 aa  60.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.468222 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1611  Methicillin resistance protein  26.17 
 
 		 370 aa  60.1  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_985  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.63 
 
 		 1079 aa  59.3  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0373  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  20.47 
 
 		 1075 aa  59.3  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2858  methicillin resistance protein  24.12 
 
 		 342 aa  58.5  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2484  carbamoyl phosphate synthase-like protein  24.3 
 
 		 354 aa  58.2  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.834927  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0083  methicillin resistance protein  24.09 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1202  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.29 
 
 		 1089 aa  56.2  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0164  ATP-grasp enzyme-like  25.57 
 
 		 416 aa  56.6  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0139  hypothetical protein  23.49 
 
 		 410 aa  56.6  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1710  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.49 
 
 		 1136 aa  56.2  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485747 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8162  Methicillin resistance protein  24.72 
 
 		 343 aa  56.6  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848631  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4534  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.26 
 
 		 1067 aa  55.8  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0352  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.48 
 
 		 1075 aa  55.8  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000999114  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0127  hypothetical protein  24.78 
 
 		 404 aa  55.1  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1012  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  23.29 
 
 		 1079 aa  55.1  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2408  methicillin resistance protein  23.83 
 
 		 363 aa  54.7  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4843  Methicillin resistance protein  25.38 
 
 		 360 aa  54.7  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000953777  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5796  Methicillin resistance protein  25.81 
 
 		 370 aa  54.7  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2232  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.12 
 
 		 1079 aa  53.5  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.251597  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1739  femAB family protein  23.49 
 
 		 354 aa  53.1  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00186266  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3198  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.12 
 
 		 1130 aa  52.8  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00397433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0668  ATP-grasp protein-like protein  24.27 
 
 		 393 aa  52.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1609  Methicillin resistance protein  22.15 
 
 		 347 aa  52.8  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3975  methicillin resistance protein  26.24 
 
 		 366 aa  52.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1308  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  21.82 
 
 		 1082 aa  52.4  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1087  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.37 
 
 		 1062 aa  51.6  0.00005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0961  methicillin resistance protein  25.12 
 
 		 359 aa  51.2  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1598  Methicillin resistance protein  23.04 
 
 		 364 aa  51.2  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.075491  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6859  ATP-grasp enzyme-like protein  23.84 
 
 		 400 aa  51.2  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0124  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.14 
 
 		 938 aa  50.8  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1446  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.68 
 
 		 1066 aa  50.4  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2200  ATP-grasp protein-like protein  24.17 
 
 		 390 aa  50.4  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3102  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  21.39 
 
 		 1100 aa  50.1  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1393  hypothetical protein  24 
 
 		 331 aa  50.1  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.238447  normal  0.393853 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3132  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  20.76 
 
 		 1101 aa  49.7  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.288772  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0882  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  24.22 
 
 		 1063 aa  48.9  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0146  hypothetical protein  25 
 
 		 382 aa  48.9  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1057  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  21.35 
 
 		 1103 aa  48.9  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.614826  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0779  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  21.17 
 
 		 1068 aa  48.5  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0332696  hitchhiker  0.000231672 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3911  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.96 
 
 		 1066 aa  48.9  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.123492 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1569  hypothetical protein  23.04 
 
 		 412 aa  48.5  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1684  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  19.26 
 
 		 1071 aa  48.9  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000705985  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12690  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  20.85 
 
 		 1118 aa  48.9  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0359466  normal  0.0639836 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2405  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  20.24 
 
 		 1099 aa  48.5  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1302  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  21.07 
 
 		 1082 aa  48.1  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0885  Methicillin resistance protein  26.09 
 
 		 357 aa  48.1  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1256  Methicillin resistance protein  23.08 
 
 		 347 aa  48.1  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000274445 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3672  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.84 
 
 		 1067 aa  47.8  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0247546  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2536  protein of unknown function DUF201  26.67 
 
 		 359 aa  48.1  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.505707  normal  0.139385 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3603  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.84 
 
 		 1067 aa  47.4  0.0009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0771  methicillin resistance protein  26.34 
 
 		 377 aa  47.4  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.455727  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0792  methicillin resistance protein  26.97 
 
 		 337 aa  46.6  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114115  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1281  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  21.26 
 
 		 1074 aa  46.2  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2417  methicillin resistance protein  21.99 
 
 		 366 aa  46.2  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00836283  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0008  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.1 
 
 		 1080 aa  46.2  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.196188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0663  hypothetical protein  28.93 
 
 		 332 aa  46.6  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0665  protein of unknown function DUF201  20.32 
 
 		 386 aa  46.2  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0741  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.96 
 
 		 1040 aa  46.2  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0661  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.08 
 
 		 1066 aa  45.8  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00149325  normal  0.138255 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3514  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.57 
 
 		 1067 aa  45.8  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.191871  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3045  methicillin resistance protein  26.75 
 
 		 335 aa  45.8  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1774  hypothetical protein  27.45 
 
 		 312 aa  45.8  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14770  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  20.49 
 
 		 1117 aa  45.8  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1574  protein tyrosine phosphatase  22.28 
 
 		 695 aa  45.4  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.354937  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0319  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.11 
 
 		 1084 aa  45.1  0.005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1999  carbamoyl phosphate synthase large subunit  19.72 
 
 		 1109 aa  45.1  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000570089 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1972  hypothetical protein  25.91 
 
 		 349 aa  44.7  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0946  D-alanine--D-alanine ligase  22.17 
 
 		 318 aa  44.7  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1729  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.05 
 
 		 1077 aa  44.3  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16380  uncharacterized methicillin resistance protein  24.27 
 
 		 329 aa  44.3  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2118  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.05 
 
 		 1077 aa  44.3  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2208  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.05 
 
 		 1077 aa  44.3  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2376  hypothetical protein  25.36 
 
 		 404 aa  44.3  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>