22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3349 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3349  hypothetical protein  100 
 
 		 364 aa  755    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1247  femAB family protein  32.75 
 
 		 352 aa  70.5  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0970  hypothetical protein  29.75 
 
 		 346 aa  63.5  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.534214  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2093  Methicillin resistance protein  28.83 
 
 		 346 aa  63.2  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.801885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0663  hypothetical protein  26.54 
 
 		 332 aa  57.8  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1598  Methicillin resistance protein  26.7 
 
 		 364 aa  56.2  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.075491  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3045  methicillin resistance protein  29.71 
 
 		 335 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4673  methicillin resistance protein  24.88 
 
 		 383 aa  53.1  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4843  Methicillin resistance protein  25.54 
 
 		 360 aa  51.6  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000953777  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1294  Methicillin resistance protein  25.31 
 
 		 340 aa  51.6  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.402759 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2408  methicillin resistance protein  27.4 
 
 		 363 aa  51.6  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5796  Methicillin resistance protein  24.34 
 
 		 370 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3173  hypothetical protein  23.83 
 
 		 334 aa  47.4  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.298047 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1611  Methicillin resistance protein  25.93 
 
 		 370 aa  47.4  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5112  hypothetical protein  27.69 
 
 		 336 aa  47.4  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0964659  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0739  methicillin resistance protein  27.54 
 
 		 368 aa  46.6  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.274792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0801  Methicillin resistance protein  25.29 
 
 		 373 aa  45.8  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0767  hypothetical protein  28.22 
 
 		 308 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.226226 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3044  hypothetical protein  25.82 
 
 		 340 aa  44.3  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8162  Methicillin resistance protein  24.38 
 
 		 343 aa  43.5  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848631  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0961  methicillin resistance protein  26.32 
 
 		 359 aa  43.1  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1444  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  25.31 
 
 		 339 aa  43.1  0.007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.593499  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>