35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1667 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1667  hypothetical protein  100 
 
 		 404 aa  834    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1226  hypothetical protein  53.17 
 
 		 413 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0671994  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1314  hypothetical protein  51.59 
 
 		 413 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0855  hypothetical protein  49.09 
 
 		 416 aa  353  4e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  0.24212 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2698  hypothetical protein  29.29 
 
 		 400 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.402222  normal  0.567569 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2504  hypothetical protein  26.7 
 
 		 373 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.81186  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1603  putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  29.82 
 
 		 400 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.241513  normal  0.216431 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5867  putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  29.56 
 
 		 434 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0325984  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0307  putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  28.87 
 
 		 394 aa  126  9e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1158  hypothetical protein  30 
 
 		 400 aa  125  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1884  putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  29.82 
 
 		 400 aa  124  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.069247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3092  conserved hypothetical protein; putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  26.89 
 
 		 397 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0510959  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4604  hypothetical protein  28.19 
 
 		 406 aa  121  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1636  conserved hypothetical protein; putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  29.97 
 
 		 397 aa  120  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.564108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2685  hypothetical protein  28.64 
 
 		 399 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0527922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2662  hypothetical protein  28.04 
 
 		 400 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.752873  normal  0.243579 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1416  hypothetical protein  26.6 
 
 		 395 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2462  hypothetical protein  26.98 
 
 		 397 aa  108  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2995  hypothetical protein  25.72 
 
 		 437 aa  108  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674295 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2282  hypothetical protein  26.84 
 
 		 406 aa  97.4  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.282627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0249  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  27.07 
 
 		 421 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.801675 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5371  putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  25.54 
 
 		 398 aa  90.1  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.219837 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0382  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  24.08 
 
 		 375 aa  89.4  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1959  hypothetical protein  28.99 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3065  hypothetical protein  26.69 
 
 		 348 aa  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0204721  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2472  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  31.02 
 
 		 344 aa  52  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2610  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  27.56 
 
 		 401 aa  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2749  hypothetical protein  23 
 
 		 380 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2731  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  32.23 
 
 		 376 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2826  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  32.23 
 
 		 376 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198113  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1673  glycosyl transferase, group 1  29.81 
 
 		 355 aa  47  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.198509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1775  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  31.02 
 
 		 344 aa  46.2  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2645  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  32.2 
 
 		 376 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0101166  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2469  hypothetical protein  26.16 
 
 		 344 aa  43.5  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2371  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  24.14 
 
 		 368 aa  43.1  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>