41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4604 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4604  hypothetical protein  100 
 
 		 406 aa  829    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2685  hypothetical protein  65.82 
 
 		 399 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0527922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2698  hypothetical protein  62.56 
 
 		 400 aa  498  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.402222  normal  0.567569 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2662  hypothetical protein  62.91 
 
 		 400 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.752873  normal  0.243579 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3092  conserved hypothetical protein; putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  61.73 
 
 		 397 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0510959  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1416  hypothetical protein  62.4 
 
 		 395 aa  465  9.999999999999999e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2462  hypothetical protein  60.71 
 
 		 397 aa  465  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5867  putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  36.98 
 
 		 434 aa  189  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0325984  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1603  putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  35.59 
 
 		 400 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.241513  normal  0.216431 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0307  putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  33.6 
 
 		 394 aa  177  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1884  putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  35.84 
 
 		 400 aa  177  4e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.069247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1636  conserved hypothetical protein; putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  33.51 
 
 		 397 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.564108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5371  putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  34.04 
 
 		 398 aa  155  9e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.219837 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1667  hypothetical protein  27.92 
 
 		 404 aa  133  6e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1226  hypothetical protein  27.42 
 
 		 413 aa  126  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0671994  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1314  hypothetical protein  27.78 
 
 		 413 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2282  hypothetical protein  30.08 
 
 		 406 aa  123  6e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.282627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0855  hypothetical protein  28.46 
 
 		 416 aa  122  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  0.24212 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2995  hypothetical protein  27.2 
 
 		 437 aa  111  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674295 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0382  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  26.69 
 
 		 375 aa  106  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2504  hypothetical protein  24.54 
 
 		 373 aa  102  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.81186  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0249  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  27.35 
 
 		 421 aa  92  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.801675 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1158  hypothetical protein  27.97 
 
 		 400 aa  88.6  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2749  hypothetical protein  25.77 
 
 		 380 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3148  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  26.46 
 
 		 377 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2707  hypothetical protein  26.05 
 
 		 380 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.710813  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0672  hypothetical protein  22.49 
 
 		 408 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2371  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  25.39 
 
 		 368 aa  52.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1673  glycosyl transferase, group 1  26.79 
 
 		 355 aa  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.198509  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4322  Tetratricopeptide domain protein  23.63 
 
 		 550 aa  51.2  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576139 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07781  cellulose biosynthesis protein CelD  19.21 
 
 		 386 aa  50.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0132299 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0961  glycosyl transferase, group 1  26.79 
 
 		 358 aa  50.1  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2729  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  25.91 
 
 		 393 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.052022  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0440  hypothetical protein  33 
 
 		 372 aa  48.9  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.463768 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2824  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  25.91 
 
 		 393 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879866  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3294  cellulose biosynthesis protein CelD  25.28 
 
 		 424 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.421998  normal  0.0110847 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2643  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  25.62 
 
 		 392 aa  47.4  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.140676  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7661  polysaccharide biosynthesis protein CelD  26.96 
 
 		 363 aa  47.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2610  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  27.27 
 
 		 401 aa  46.6  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1959  hypothetical protein  21.52 
 
 		 336 aa  45.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1928  polysaccharide biosynthesis protein CelD  26.12 
 
 		 364 aa  44.3  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411311  normal  0.123399 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>