22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7661 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7661  polysaccharide biosynthesis protein CelD  100 
 
 
363 aa  728    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3602  polysaccharide biosynthesis protein CelD  59.78 
 
 
363 aa  413  1e-114  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.317396  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1930  polysaccharide biosynthesis protein CelD  54.44 
 
 
360 aa  373  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0135323  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7654  cellulose biosynthesis protein CelD  50.14 
 
 
376 aa  352  5.9999999999999994e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1928  polysaccharide biosynthesis protein CelD  49.58 
 
 
364 aa  337  9.999999999999999e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411311  normal  0.123399 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3587  hypothetical protein  43.37 
 
 
363 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1351  hypothetical protein  34.55 
 
 
376 aa  140  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1755  cellulose biosynthesis protein CelD  28.62 
 
 
359 aa  135  9.999999999999999e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189987  normal  0.140777 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2354  hypothetical protein  32.69 
 
 
381 aa  135  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4871  hypothetical protein  33.44 
 
 
360 aa  130  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0656  hypothetical protein  32.62 
 
 
349 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0440  hypothetical protein  29.17 
 
 
372 aa  125  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.463768 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1683  cellulose biosynthetic (CelD)-like protein  31.51 
 
 
359 aa  125  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.548843  normal  0.0452897 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0664  cellulose biosynthesis protein CelD  27.6 
 
 
326 aa  57  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.250925 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2685  hypothetical protein  30.29 
 
 
399 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0527922  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2462  hypothetical protein  29.79 
 
 
397 aa  50.8  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4604  hypothetical protein  26.96 
 
 
406 aa  47  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3092  conserved hypothetical protein; putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  27.84 
 
 
397 aa  46.6  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0510959  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0683  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  34.83 
 
 
436 aa  44.3  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0307  putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  32.48 
 
 
394 aa  44.7  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1797  hypothetical protein  23.4 
 
 
389 aa  43.5  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0769202  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2371  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  34.44 
 
 
368 aa  42.7  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>