20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3587 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3587  hypothetical protein  100 
 
 
363 aa  736    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7654  cellulose biosynthesis protein CelD  51.91 
 
 
376 aa  382  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1928  polysaccharide biosynthesis protein CelD  51.8 
 
 
364 aa  364  1e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411311  normal  0.123399 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3602  polysaccharide biosynthesis protein CelD  48.08 
 
 
363 aa  310  2e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.317396  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7661  polysaccharide biosynthesis protein CelD  43.37 
 
 
363 aa  306  4.0000000000000004e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1930  polysaccharide biosynthesis protein CelD  39.39 
 
 
360 aa  257  3e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0135323  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2354  hypothetical protein  32.37 
 
 
381 aa  153  5e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0656  hypothetical protein  33.53 
 
 
349 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1755  cellulose biosynthesis protein CelD  29.28 
 
 
359 aa  150  4e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189987  normal  0.140777 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1683  cellulose biosynthetic (CelD)-like protein  30.95 
 
 
359 aa  149  7e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.548843  normal  0.0452897 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4871  hypothetical protein  32.18 
 
 
360 aa  149  9e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0440  hypothetical protein  28.8 
 
 
372 aa  145  1e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.463768 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1351  hypothetical protein  30.55 
 
 
376 aa  140  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1179  cellulose biosynthesis protein CelD  28.21 
 
 
411 aa  55.8  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.60809 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0664  cellulose biosynthesis protein CelD  26.47 
 
 
326 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.250925 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2685  hypothetical protein  28.05 
 
 
399 aa  50.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0527922  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2371  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  25.17 
 
 
368 aa  45.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5312  hypothetical protein  25.95 
 
 
374 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.768259  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2995  hypothetical protein  24.88 
 
 
437 aa  45.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.674295 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0345  hypothetical protein  23.38 
 
 
338 aa  43.9  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.301298  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>