21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4871 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4871  hypothetical protein  100 
 
 
360 aa  725    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1928  polysaccharide biosynthesis protein CelD  32.94 
 
 
364 aa  172  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411311  normal  0.123399 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3587  hypothetical protein  32.18 
 
 
363 aa  157  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7654  cellulose biosynthesis protein CelD  33.11 
 
 
376 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1683  cellulose biosynthetic (CelD)-like protein  28.81 
 
 
359 aa  153  4e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.548843  normal  0.0452897 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0656  hypothetical protein  33.63 
 
 
349 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0440  hypothetical protein  30.4 
 
 
372 aa  145  1e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.463768 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2354  hypothetical protein  34.4 
 
 
381 aa  145  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1755  cellulose biosynthesis protein CelD  28.57 
 
 
359 aa  144  3e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189987  normal  0.140777 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1351  hypothetical protein  30.5 
 
 
376 aa  140  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7661  polysaccharide biosynthesis protein CelD  33.44 
 
 
363 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3602  polysaccharide biosynthesis protein CelD  30.06 
 
 
363 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.317396  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1930  polysaccharide biosynthesis protein CelD  28.3 
 
 
360 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0135323  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2749  hypothetical protein  26.4 
 
 
380 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2707  hypothetical protein  26.61 
 
 
380 aa  47  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.710813  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3148  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  26.92 
 
 
377 aa  46.6  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1416  hypothetical protein  33.68 
 
 
395 aa  43.9  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2698  hypothetical protein  23.46 
 
 
400 aa  43.5  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.402222  normal  0.567569 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0664  cellulose biosynthesis protein CelD  25.49 
 
 
326 aa  43.5  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.250925 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2464  putative cellulose biosynthesis (CelD) protein  37.5 
 
 
377 aa  42.7  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1783  putative cellulose biosynthesis (CelD) protein  27.19 
 
 
376 aa  42.7  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.594262  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>