38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3092 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3092  conserved hypothetical protein; putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  100 
 
 		 397 aa  815    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0510959  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2698  hypothetical protein  70.5 
 
 		 400 aa  558  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.402222  normal  0.567569 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2662  hypothetical protein  70.25 
 
 		 400 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.752873  normal  0.243579 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2685  hypothetical protein  60.65 
 
 		 399 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0527922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4604  hypothetical protein  61.73 
 
 		 406 aa  476  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1416  hypothetical protein  62.33 
 
 		 395 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2462  hypothetical protein  60.86 
 
 		 397 aa  461  9.999999999999999e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5867  putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  35.2 
 
 		 434 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0325984  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0307  putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  34.07 
 
 		 394 aa  186  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1603  putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  33.86 
 
 		 400 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.241513  normal  0.216431 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1884  putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  33.33 
 
 		 400 aa  170  4e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.069247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1636  conserved hypothetical protein; putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  32.71 
 
 		 397 aa  170  5e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.564108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5371  putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  34.48 
 
 		 398 aa  159  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.219837 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2995  hypothetical protein  28.68 
 
 		 437 aa  141  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674295 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1667  hypothetical protein  27.89 
 
 		 404 aa  140  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2282  hypothetical protein  31.3 
 
 		 406 aa  136  8e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.282627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1226  hypothetical protein  26.2 
 
 		 413 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0671994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0855  hypothetical protein  28.82 
 
 		 416 aa  123  5e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  0.24212 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1314  hypothetical protein  25.8 
 
 		 413 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0382  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  27.08 
 
 		 375 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2504  hypothetical protein  24.47 
 
 		 373 aa  109  7.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.81186  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1158  hypothetical protein  28.2 
 
 		 400 aa  90.5  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2749  hypothetical protein  25.29 
 
 		 380 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0672  hypothetical protein  24.42 
 
 		 408 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0249  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  24.58 
 
 		 421 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.801675 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3148  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  25.6 
 
 		 377 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3294  cellulose biosynthesis protein CelD  26.15 
 
 		 424 aa  75.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.421998  normal  0.0110847 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2707  hypothetical protein  24.34 
 
 		 380 aa  74.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.710813  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0656  hypothetical protein  25.25 
 
 		 349 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07781  cellulose biosynthesis protein CelD  19.02 
 
 		 386 aa  51.2  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0132299 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0440  hypothetical protein  30.08 
 
 		 372 aa  49.7  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.463768 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1928  polysaccharide biosynthesis protein CelD  26.67 
 
 		 364 aa  48.9  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411311  normal  0.123399 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1016  glycosyl transferase, group 1  26.72 
 
 		 689 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7661  polysaccharide biosynthesis protein CelD  27.84 
 
 		 363 aa  46.2  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0961  glycosyl transferase, group 1  27.81 
 
 		 358 aa  45.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1673  glycosyl transferase, group 1  24.4 
 
 		 355 aa  44.3  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.198509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2371  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  26.01 
 
 		 368 aa  43.5  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0664  cellulose biosynthesis protein CelD  28.46 
 
 		 326 aa  43.1  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.250925 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>