16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_5003 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_5003  hypothetical protein  100 
 
 		 375 aa  773    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.403885  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5827  cellulose biosynthesis protein CelD  25.35 
 
 		 397 aa  98.6  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.297647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1625  hypothetical protein  22.28 
 
 		 373 aa  75.9  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.370324  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1200  hypothetical protein  24.63 
 
 		 378 aa  72.8  0.000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1016  glycosyl transferase, group 1  19.45 
 
 		 689 aa  63.5  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3884  hypothetical protein  22.46 
 
 		 420 aa  62.8  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3071  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  22.82 
 
 		 393 aa  61.6  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1556  cellulose biosynthesis protein CelD  27.06 
 
 		 378 aa  59.3  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2360  cellulose biosynthesis protein CelD  22.9 
 
 		 382 aa  57.8  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1077  glycosyl transferase group 1  24.81 
 
 		 690 aa  53.9  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.383593  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2371  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  19.71 
 
 		 368 aa  53.1  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1074  glycosyl transferase group 1  24.03 
 
 		 690 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1003  hypothetical protein  24.54 
 
 		 325 aa  45.8  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.305983  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0159  hypothetical protein  19.16 
 
 		 370 aa  45.8  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2017  hypothetical protein  21.41 
 
 		 369 aa  44.7  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.555196  normal  0.0726848 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01309  hypothetical protein  23.63 
 
 		 368 aa  43.9  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.127385  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>