152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2008 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2008  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 730 aa  1488    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.196869  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1712  TPR repeat-containing protein  61.17 
 
 		 817 aa  641    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.347733  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0873  TPR repeat-containing protein  49.91 
 
 		 567 aa  555  1e-157  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.127126  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3004  TPR repeat-containing protein  28.11 
 
 		 1082 aa  180  1e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1072  tetratricopeptide TPR_2  27.01 
 
 		 1087 aa  169  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  25.94 
 
 		 1611 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  27.04 
 
 		 1238 aa  114  5e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  22.92 
 
 		 732 aa  109  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  25.26 
 
 		 2145 aa  103  1e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3535  hypothetical protein  24.11 
 
 		 1123 aa  102  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.878105 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  23.71 
 
 		 782 aa  100  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  25.91 
 
 		 1550 aa  90.1  1e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1241  TPR repeat-containing protein  22.9 
 
 		 1366 aa  87.8  7e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0870262  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  23.73 
 
 		 828 aa  82.4  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  23.81 
 
 		 985 aa  81.3  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1912  TPR repeat-containing protein  27.66 
 
 		 578 aa  75.5  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.855004 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  24.17 
 
 		 1404 aa  74.7  0.000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  26.56 
 
 		 949 aa  73.9  0.000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  20.62 
 
 		 1914 aa  72  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  21.29 
 
 		 1060 aa  70.9  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8810  Tetratricopeptide domain protein  26.14 
 
 		 724 aa  69.7  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.872699  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0765  tetratricopeptide TPR_2  26.55 
 
 		 1180 aa  69.3  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.82828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  25.1 
 
 		 801 aa  67.8  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  23.35 
 
 		 1266 aa  67  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.07 
 
 		 991 aa  67  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6111  hypothetical protein  23.95 
 
 		 599 aa  65.5  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  25 
 
 		 825 aa  65.5  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6113  hypothetical protein  25.68 
 
 		 596 aa  65.1  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38879  predicted protein  23.83 
 
 		 807 aa  64.7  0.000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.192146  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0229  tetratricopeptide TPR_3  23.75 
 
 		 689 aa  64.3  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  25.89 
 
 		 1040 aa  63.5  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49558  predicted protein  21.77 
 
 		 1106 aa  63.9  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.022156  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  26.33 
 
 		 1676 aa  62.4  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  23.16 
 
 		 810 aa  62  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  22.53 
 
 		 740 aa  62  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  25.3 
 
 		 1056 aa  60.8  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  16.87 
 
 		 725 aa  60.1  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3533  hypothetical protein  22.57 
 
 		 338 aa  59.3  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.674186  normal  0.782695 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  22.5 
 
 		 1009 aa  59.7  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  22.19 
 
 		 878 aa  59.7  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1817  TPR repeat-containing protein  30.41 
 
 		 945 aa  60.1  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.703136  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  24.41 
 
 		 1212 aa  59.7  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  25.36 
 
 		 927 aa  58.9  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2652  hypothetical protein  24.38 
 
 		 919 aa  58.9  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00496775  normal  0.0664064 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0894  TPR-related region  25.81 
 
 		 364 aa  58.5  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179778 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  28.85 
 
 		 594 aa  58.5  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1936  TPR repeat-containing protein  26.87 
 
 		 1911 aa  58.2  0.0000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.261102  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0438  signal transduction histidine kinase-like protein  25.88 
 
 		 755 aa  58.2  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.128515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  22.94 
 
 		 1228 aa  57.8  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3729  TPR-related region  25 
 
 		 340 aa  56.2  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0045227  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.2 
 
 		 988 aa  55.5  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  22.18 
 
 		 1261 aa  55.5  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  22.22 
 
 		 694 aa  55.5  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0160  TPR repeat-containing protein  19.59 
 
 		 897 aa  55.1  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  25 
 
 		 2413 aa  55.1  0.000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  22.16 
 
 		 843 aa  54.7  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  24.11 
 
 		 827 aa  54.7  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3214  hypothetical protein  21.68 
 
 		 691 aa  54.3  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.68 
 
 		 1056 aa  54.3  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4338  hypothetical protein  23.19 
 
 		 711 aa  53.9  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.969695 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2583  TPR repeat-containing protein  18.32 
 
 		 1714 aa  53.5  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.39 
 
 		 818 aa  53.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.07 
 
 		 2240 aa  53.1  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  20.34 
 
 		 1526 aa  53.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  24.58 
 
 		 493 aa  52.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  23.94 
 
 		 1486 aa  52.8  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43422  predicted protein  25.27 
 
 		 836 aa  52.4  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.293567  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3130  TPR repeat-containing protein  19.92 
 
 		 408 aa  52  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180384 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_52685  beta-glucan elicitor receptor  21.66 
 
 		 708 aa  52  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370371  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.51 
 
 		 758 aa  52  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  25.76 
 
 		 837 aa  52  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2207  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.85 
 
 		 760 aa  52  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166244 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  21.99 
 
 		 1154 aa  51.6  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4641  hypothetical protein  28.68 
 
 		 457 aa  51.6  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  23.9 
 
 		 1297 aa  51.2  0.00006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0283  TPR repeat-containing protein  28.66 
 
 		 854 aa  51.6  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  23.98 
 
 		 594 aa  51.2  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  25.67 
 
 		 361 aa  51.2  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.26 
 
 		 784 aa  51.2  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  22.19 
 
 		 792 aa  51.2  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  22.65 
 
 		 828 aa  50.8  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  25.57 
 
 		 750 aa  50.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2873  SEFIR domain protein  26.85 
 
 		 830 aa  50.1  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.205836  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1249  TPR repeat-containing protein  27.2 
 
 		 702 aa  50.4  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0879927  normal  0.272595 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2406  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.73 
 
 		 852 aa  49.7  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  normal  0.385932 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  22.65 
 
 		 828 aa  49.3  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0258  TPR repeat-containing protein  24.03 
 
 		 974 aa  50.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0976  transcriptional regulator, XRE family  24.35 
 
 		 775 aa  48.9  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2267  TPR repeat-containing protein  20.83 
 
 		 1519 aa  49.3  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  23.02 
 
 		 279 aa  49.3  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  23.76 
 
 		 909 aa  48.9  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  21.94 
 
 		 605 aa  48.9  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  22.02 
 
 		 397 aa  48.5  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1752  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.88 
 
 		 409 aa  48.1  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  23.02 
 
 		 1737 aa  47.8  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0414  hypothetical protein  22.47 
 
 		 490 aa  47.8  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0243225  normal  0.732046 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1290  TPR repeat-containing protein  22.98 
 
 		 343 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  24.67 
 
 		 626 aa  47  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0944  transcriptional regulatory protein-like protein  25.9 
 
 		 1131 aa  46.6  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.80445  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  25.71 
 
 		 809 aa  47.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>