More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2393 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2393  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 944 aa  1840    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0195  TPR repeat-containing protein  30.46 
 
 		 931 aa  329  2.0000000000000001e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0376  tetratricopeptide TPR_4  29.28 
 
 		 929 aa  321  3e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  27.47 
 
 		 934 aa  286  1.0000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0196  TPR repeat-containing protein  32.05 
 
 		 927 aa  277  7e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2439  TPR repeat-containing protein  26.57 
 
 		 923 aa  216  9.999999999999999e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.427579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0156  TPR repeat-containing protein  29.93 
 
 		 955 aa  210  9e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2499  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  28.66 
 
 		 935 aa  210  1e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00842249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0705  tetratricopeptide TPR_2  27.08 
 
 		 924 aa  196  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1620  TPR repeat-containing protein  24.63 
 
 		 900 aa  162  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  23.66 
 
 		 883 aa  139  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03692  TPR domain protein  24.58 
 
 		 924 aa  138  4e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3097  hypothetical protein  27.02 
 
 		 933 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.681672  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  24.66 
 
 		 729 aa  124  6e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1628  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  26.75 
 
 		 924 aa  124  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57702  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1201  tetratricopeptide TPR_2  22.07 
 
 		 918 aa  122  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.173975  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1987  TPR domain-containing protein  26.33 
 
 		 864 aa  118  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0419  TPR repeat-containing protein  23.5 
 
 		 917 aa  115  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1943  TPR repeat-containing protein  25.58 
 
 		 952 aa  110  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.102548 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0310  TPR domain-containing protein  21.29 
 
 		 892 aa  107  9e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  22.58 
 
 		 1676 aa  106  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01444  TPR repeat protein  23.23 
 
 		 937 aa  106  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0688079  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2480  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  23.14 
 
 		 882 aa  105  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  23.19 
 
 		 860 aa  104  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  23.24 
 
 		 884 aa  104  9e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2959  tetratricopeptide TPR_4  26.22 
 
 		 939 aa  104  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.83474  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1767  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  23.14 
 
 		 882 aa  97.8  8e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3073  TPR repeat-containing protein  26.14 
 
 		 886 aa  97.4  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2579  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.88 
 
 		 786 aa  97.4  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1338  tetratricopeptide TPR_2  22.43 
 
 		 931 aa  95.9  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2224  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  23.6 
 
 		 884 aa  95.5  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  22.31 
 
 		 878 aa  95.1  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0528  TPR domain-containing protein  20.66 
 
 		 917 aa  93.6  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668736  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0828  TPR repeat-containing protein  24.19 
 
 		 886 aa  94.4  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0423  TPR repeat-containing protein  20.96 
 
 		 880 aa  91.3  7e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0262641 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  24.57 
 
 		 725 aa  88.2  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  23.49 
 
 		 733 aa  87.4  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  21.9 
 
 		 810 aa  84  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  24.28 
 
 		 1069 aa  84  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0912  TPR repeat-containing protein  23.07 
 
 		 748 aa  82.8  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.795031  hitchhiker  0.00626987 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0691  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  23.81 
 
 		 883 aa  81.6  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.953113 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.9 
 
 		 2240 aa  80.1  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  23.84 
 
 		 3145 aa  79.7  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  25.07 
 
 		 827 aa  79.3  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  22.29 
 
 		 887 aa  79.3  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  24.82 
 
 		 586 aa  78.6  0.0000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.02 
 
 		 557 aa  78.2  0.0000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 767 aa  77.4  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  24.09 
 
 		 567 aa  77.4  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2583  TPR repeat-containing protein  23.04 
 
 		 729 aa  77.4  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3161  tetratricopeptide TPR_2  26.87 
 
 		 444 aa  77.4  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0769  TPR repeat-containing protein  26.7 
 
 		 573 aa  76.3  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.16 
 
 		 553 aa  75.5  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0725  TPR domain-containing protein  26.03 
 
 		 573 aa  75.5  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.883173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  25.37 
 
 		 603 aa  75.5  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1530  TPR repeat-containing protein  25.65 
 
 		 873 aa  75.5  0.000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0304158  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  21.85 
 
 		 927 aa  74.7  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  28.37 
 
 		 614 aa  74.3  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  21.45 
 
 		 676 aa  73.9  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  28.37 
 
 		 626 aa  74.3  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  21.84 
 
 		 573 aa  73.6  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  25.76 
 
 		 313 aa  73.2  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  25.33 
 
 		 808 aa  73.6  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0759  TPR repeat-containing protein  26.03 
 
 		 573 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.449417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4396  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.74 
 
 		 602 aa  73.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4458  TPR repeat-containing protein  26.16 
 
 		 573 aa  72.8  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.11 
 
 		 632 aa  72.8  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  28.03 
 
 		 614 aa  72  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  28.03 
 
 		 614 aa  72  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  28.03 
 
 		 614 aa  72  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  28.03 
 
 		 626 aa  72  0.00000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  25.51 
 
 		 587 aa  71.2  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0276  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.7 
 
 		 624 aa  71.2  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  24.38 
 
 		 837 aa  70.9  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2838  tetratricopeptide TPR_2  20.8 
 
 		 940 aa  70.9  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 366 aa  70.5  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  23.52 
 
 		 505 aa  69.7  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0318  TPR repeat-containing protein  24.31 
 
 		 613 aa  70.5  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0135252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  24.22 
 
 		 566 aa  70.1  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0781  TPR domain-containing protein  20.51 
 
 		 924 aa  69.7  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.55707  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0701  TPR repeat-containing protein  25.72 
 
 		 652 aa  69.3  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  21.66 
 
 		 1067 aa  69.3  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  21.54 
 
 		 565 aa  69.3  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1127  TPR domain-containing protein  24.05 
 
 		 725 aa  68.9  0.0000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  29.07 
 
 		 614 aa  68.9  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2321  TPR repeat-containing protein  25.62 
 
 		 475 aa  68.9  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.084712  decreased coverage  0.00212856 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0995  tetratricopeptide TPR_2  22.43 
 
 		 614 aa  69.3  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129848  normal  0.103443 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  27.54 
 
 		 545 aa  68.6  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  21.16 
 
 		 568 aa  68.6  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  21.05 
 
 		 750 aa  68.2  0.0000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  28.37 
 
 		 626 aa  67.8  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0342  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.64 
 
 		 582 aa  67.4  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.351016 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.36 
 
 		 818 aa  67.4  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  22.1 
 
 		 3172 aa  67.4  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  23.35 
 
 		 4079 aa  67.4  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2338  sulfotransferase  25.42 
 
 		 762 aa  67  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355943  normal  0.127881 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  22.92 
 
 		 622 aa  66.6  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  25.42 
 
 		 762 aa  67  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  21.42 
 
 		 1737 aa  66.6  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  21.03 
 
 		 936 aa  66.6  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>