More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1722 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1722  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 
354 aa  713    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1660  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  57.31 
 
 
370 aa  366  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0829  tetratricopeptide TPR_2  33.71 
 
 
394 aa  144  2e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  24.21 
 
 
1737 aa  94.7  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.46 
 
 
818 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  27.27 
 
 
1676 aa  90.5  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  25.62 
 
 
676 aa  88.6  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  27.48 
 
 
649 aa  84.7  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.66 
 
 
1056 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  30.73 
 
 
523 aa  82.4  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2441  TPR repeat-containing protein  26.69 
 
 
687 aa  81.3  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0004983  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.45 
 
 
784 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.21 
 
 
632 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  31.77 
 
 
820 aa  80.9  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.25 
 
 
373 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  26.52 
 
 
392 aa  79.3  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  25.63 
 
 
878 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.51 
 
 
1022 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25 
 
 
810 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  28.45 
 
 
301 aa  79  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  32.6 
 
 
935 aa  77.8  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  29.68 
 
 
1094 aa  78.2  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  29.8 
 
 
561 aa  78.2  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.24 
 
 
988 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.65 
 
 
565 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  27.6 
 
 
601 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  25.69 
 
 
564 aa  77  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  29.8 
 
 
561 aa  76.6  0.0000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  24.44 
 
 
594 aa  75.5  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.87 
 
 
1056 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  28.1 
 
 
4489 aa  74.7  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  24.32 
 
 
566 aa  73.6  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  23.95 
 
 
3172 aa  73.6  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  26.9 
 
 
602 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4239  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.44 
 
 
363 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  26.85 
 
 
2262 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.71 
 
 
237 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4301  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.44 
 
 
363 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.124533 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  26.49 
 
 
4079 aa  72  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0964  TPR domain-containing protein  26.5 
 
 
295 aa  72  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2286  TPR repeat-containing protein  27.39 
 
 
291 aa  71.2  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.441531 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2723  TPR repeat-containing protein  26.52 
 
 
342 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.26129  normal  0.431849 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  24.28 
 
 
3301 aa  72  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  21.86 
 
 
1154 aa  71.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  28.76 
 
 
3035 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  24.1 
 
 
711 aa  72  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  24.57 
 
 
505 aa  70.9  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.94 
 
 
707 aa  70.9  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  25.52 
 
 
1276 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0905  TPR domain-containing protein  26.72 
 
 
295 aa  70.9  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  27.22 
 
 
648 aa  70.9  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  25.65 
 
 
875 aa  70.5  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  28.38 
 
 
3560 aa  70.1  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.82 
 
 
344 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1837  TPR repeat-containing protein  28.82 
 
 
344 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  25.66 
 
 
465 aa  70.1  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  23.19 
 
 
1056 aa  70.1  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  23.15 
 
 
706 aa  70.1  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0990  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.75 
 
 
410 aa  69.7  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.113297  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  25.35 
 
 
725 aa  69.7  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  28.65 
 
 
3145 aa  69.7  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  25.09 
 
 
1192 aa  69.3  0.00000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  22.77 
 
 
750 aa  68.6  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  24.1 
 
 
927 aa  69.3  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3062  hypothetical protein  25.4 
 
 
391 aa  69.3  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  28.57 
 
 
745 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  27.72 
 
 
1421 aa  68.6  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2023  TPR domain-containing protein  27.84 
 
 
369 aa  68.2  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000313787  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  27.07 
 
 
614 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  27.07 
 
 
614 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  26.96 
 
 
594 aa  68.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  27.07 
 
 
626 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  24.69 
 
 
909 aa  68.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  27.07 
 
 
614 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1392  TPR repeat-containing protein  25.21 
 
 
301 aa  68.2  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  25.62 
 
 
816 aa  68.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6666  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.05 
 
 
839 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00671712  normal  0.283936 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  27.07 
 
 
614 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  27.07 
 
 
614 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  27.07 
 
 
626 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  31.07 
 
 
718 aa  67.8  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  21.09 
 
 
681 aa  67.4  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  25.18 
 
 
789 aa  67  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  26.58 
 
 
837 aa  67.4  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  25.63 
 
 
847 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  25.53 
 
 
605 aa  67  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  25.47 
 
 
622 aa  66.6  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  25.3 
 
 
887 aa  66.6  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  23.36 
 
 
750 aa  66.6  0.0000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  21.55 
 
 
602 aa  66.2  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  21.53 
 
 
448 aa  66.2  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  24.63 
 
 
615 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  24.33 
 
 
1979 aa  65.5  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  26.37 
 
 
955 aa  65.9  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  24.16 
 
 
764 aa  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  27.96 
 
 
573 aa  65.9  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0003  TPR repeat-containing protein  22.83 
 
 
466 aa  65.5  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5044  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.07 
 
 
233 aa  65.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  26.79 
 
 
311 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  25.1 
 
 
565 aa  65.1  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>