More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_3141 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_3141  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 		 317 aa  650    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00286611  normal  0.0160397 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  29.09 
 
 		 280 aa  103  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0192  TPR repeat-containing protein  32.77 
 
 		 349 aa  101  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.906422  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  25.8 
 
 		 1276 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  27.98 
 
 		 543 aa  98.6  1e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  27.23 
 
 		 927 aa  90.5  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  23.93 
 
 		 4079 aa  84  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  25.62 
 
 		 1694 aa  84  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.75 
 
 		 810 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  25 
 
 		 397 aa  81.3  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  27.19 
 
 		 706 aa  81.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  23.57 
 
 		 589 aa  81.3  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  22.41 
 
 		 366 aa  80.5  0.00000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.27 
 
 		 632 aa  80.1  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  24.15 
 
 		 512 aa  79.3  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 391 aa  79  0.00000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.97 
 
 		 878 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  23.35 
 
 		 465 aa  79  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  25.65 
 
 		 617 aa  78.2  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  21.4 
 
 		 562 aa  77  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  24.58 
 
 		 761 aa  77.4  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  25.29 
 
 		 344 aa  76.6  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  33.8 
 
 		 356 aa  76.6  0.0000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  27.73 
 
 		 750 aa  76.3  0.0000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  25.45 
 
 		 462 aa  75.9  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  27.11 
 
 		 409 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  25.2 
 
 		 1067 aa  74.7  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.71 
 
 		 784 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.41 
 
 		 707 aa  73.6  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  22.22 
 
 		 279 aa  73.6  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  25.89 
 
 		 602 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  24.77 
 
 		 661 aa  73.2  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 4489 aa  73.2  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  26.29 
 
 		 267 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.1 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.1 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  27.27 
 
 		 550 aa  72.8  0.000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  26.19 
 
 		 3035 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  25.21 
 
 		 334 aa  72  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  25.12 
 
 		 313 aa  72  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  28.74 
 
 		 306 aa  71.2  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  23.72 
 
 		 1013 aa  71.6  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2755  TPR repeat-containing protein  25.77 
 
 		 234 aa  71.2  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  24.32 
 
 		 1297 aa  71.2  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  27.23 
 
 		 329 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  28.43 
 
 		 1106 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  25.41 
 
 		 1827 aa  70.9  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.89 
 
 		 373 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  28.12 
 
 		 745 aa  70.5  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  25.32 
 
 		 626 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1605  tetratricopeptide TPR_2  24.86 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  26.98 
 
 		 560 aa  69.7  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  24.49 
 
 		 623 aa  69.7  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.89 
 
 		 406 aa  69.7  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.21 
 
 		 542 aa  69.7  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.89 
 
 		 406 aa  69.7  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  25.94 
 
 		 706 aa  69.3  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  25.89 
 
 		 601 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  22.86 
 
 		 718 aa  69.3  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  22.98 
 
 		 1192 aa  69.3  0.00000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  25.63 
 
 		 352 aa  68.9  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.94 
 
 		 818 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1362  TPR repeat-containing protein  23.15 
 
 		 376 aa  67.8  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  29.78 
 
 		 398 aa  68.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  25.4 
 
 		 620 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.31 
 
 		 738 aa  67.8  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  25.22 
 
 		 409 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  25 
 
 		 730 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  24.68 
 
 		 955 aa  68.2  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  27.68 
 
 		 573 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  24.66 
 
 		 820 aa  68.2  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  26.47 
 
 		 1421 aa  67.8  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  22.46 
 
 		 1276 aa  67  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  23.14 
 
 		 1007 aa  67.4  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  24.78 
 
 		 581 aa  67.4  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  27.49 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  23.88 
 
 		 436 aa  67.4  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0329  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.14 
 
 		 297 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  26.18 
 
 		 711 aa  67  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.03 
 
 		 689 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.14 
 
 		 297 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1309  TPR repeat-containing protein  25.74 
 
 		 515 aa  66.6  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1633  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.46 
 
 		 358 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000383939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  27.15 
 
 		 1127 aa  66.2  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  23.68 
 
 		 288 aa  66.2  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  24.18 
 
 		 1094 aa  66.2  0.0000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  23.91 
 
 		 314 aa  65.1  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  28.08 
 
 		 583 aa  65.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  23.53 
 
 		 2262 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  28.15 
 
 		 716 aa  65.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.82 
 
 		 739 aa  65.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0369  TPR repeat-containing protein  22.31 
 
 		 446 aa  65.1  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  23.98 
 
 		 3145 aa  65.5  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  24.29 
 
 		 597 aa  65.5  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  22.07 
 
 		 1069 aa  64.3  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.88 
 
 		 343 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  23.63 
 
 		 363 aa  64.7  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  21.9 
 
 		 635 aa  64.7  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  25.1 
 
 		 634 aa  65.1  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  26.38 
 
 		 361 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>