123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1601 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_1496  hypothetical protein  100 
 
 		 375 aa  766    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1772  hypothetical protein  100 
 
 		 375 aa  766    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000657641  normal  0.0639898 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1601  hypothetical protein  100 
 
 		 375 aa  766    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04767  hypothetical protein  52.11 
 
 		 365 aa  395  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2141  protein of unknown function DUF218  37.29 
 
 		 346 aa  172  7.999999999999999e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00423736  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4535  protein of unknown function DUF218  28.97 
 
 		 334 aa  101  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2069  protein of unknown function DUF218  30.7 
 
 		 253 aa  101  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.325026  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3249  hypothetical protein  44.25 
 
 		 202 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2964  hypothetical protein  44.74 
 
 		 233 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0815547  normal  0.415025 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0878  hypothetical protein  40.17 
 
 		 193 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0895  hypothetical protein  40.17 
 
 		 193 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0884  hypothetical protein  40.17 
 
 		 193 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.150087  normal  0.728118 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4675  hypothetical protein  33.04 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.139137  normal  0.101849 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0022  hypothetical protein  35.09 
 
 		 337 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3404  protein of unknown function DUF218  33.05 
 
 		 170 aa  65.1  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  25.6 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1258  hypothetical protein  27.33 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0643  hypothetical protein  33.33 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  24.83 
 
 		 214 aa  59.3  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2577  protein of unknown function DUF218  29.69 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.439933  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0806  hypothetical protein  30.53 
 
 		 206 aa  57  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4612  hypothetical protein  26.17 
 
 		 262 aa  57  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal  0.160891 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1684  protein of unknown function DUF218  30.7 
 
 		 195 aa  55.8  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3555  hypothetical protein  31.86 
 
 		 275 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0775  hypothetical protein, putative phage gene  30.3 
 
 		 337 aa  55.8  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.626314  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2382  hypothetical protein  24.65 
 
 		 264 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371494  normal  0.708351 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4365  hypothetical protein  27.97 
 
 		 210 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.980357  hitchhiker  0.000669718 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4882  hypothetical protein  27.97 
 
 		 219 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000206501 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  24.38 
 
 		 280 aa  54.3  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3776  hypothetical protein  34.96 
 
 		 280 aa  54.3  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.892211  normal  0.779131 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2380  hypothetical protein  32.59 
 
 		 253 aa  53.9  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1055  protein of unknown function DUF218  29.66 
 
 		 195 aa  53.9  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000273108 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  26.49 
 
 		 242 aa  53.5  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3338  hypothetical protein  26.45 
 
 		 264 aa  53.5  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0793  hypothetical protein  29.77 
 
 		 206 aa  53.5  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.112822  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3208  protein of unknown function DUF218  28.81 
 
 		 196 aa  53.5  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000349402  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3453  hypothetical protein  27.68 
 
 		 262 aa  53.1  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0761  protein of unknown function DUF218  24.72 
 
 		 262 aa  52.8  0.000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0376  protein of unknown function DUF218  30.65 
 
 		 258 aa  52.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19360  hypothetical protein  35.4 
 
 		 246 aa  51.6  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000354408 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  30.69 
 
 		 237 aa  51.6  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  31.13 
 
 		 237 aa  51.6  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3570  protein of unknown function DUF218  23.33 
 
 		 264 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4276  protein of unknown function DUF218  30.65 
 
 		 272 aa  51.2  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4373  protein of unknown function DUF218  28.85 
 
 		 262 aa  51.2  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  0.225585 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2551  hypothetical protein  29.31 
 
 		 206 aa  51.2  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3072  hypothetical protein  23.24 
 
 		 264 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1816  hypothetical protein  27.73 
 
 		 166 aa  51.2  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0359339  normal  0.0830506 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0886  hypothetical protein  28.83 
 
 		 236 aa  50.8  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.351499  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3403  hypothetical protein  25.74 
 
 		 280 aa  50.4  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1019  hypothetical protein  31.53 
 
 		 461 aa  50.1  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000506367  unclonable  0.00000000514024 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  28.46 
 
 		 256 aa  50.1  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2431  hypothetical protein  23.61 
 
 		 267 aa  50.1  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53127  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0467  hypothetical protein  35.11 
 
 		 264 aa  50.1  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2397  integral membrane protein  32.2 
 
 		 250 aa  49.3  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3048  hypothetical protein  24.51 
 
 		 280 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.09156  normal  0.289832 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1689  hypothetical protein  33.33 
 
 		 176 aa  49.3  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.143634  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0951  hypothetical protein  30.91 
 
 		 271 aa  49.3  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4052  protein of unknown function DUF218  29.47 
 
 		 262 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0889  protein of unknown function DUF218  30.91 
 
 		 236 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.779041  hitchhiker  0.000145326 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3433  hypothetical protein  29.2 
 
 		 230 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4935  hypothetical protein  29.2 
 
 		 230 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000188472 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2014  hypothetical protein  26.39 
 
 		 235 aa  48.5  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3336  hypothetical protein  27.12 
 
 		 165 aa  48.1  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5353  hypothetical protein  29.2 
 
 		 230 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00600694  normal  0.075763 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4924  hypothetical protein  27.15 
 
 		 345 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3157  hypothetical protein  26.13 
 
 		 199 aa  47.8  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000253328  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0755  protein of unknown function DUF218  27.55 
 
 		 264 aa  47.8  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000325401 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1032  protein of unknown function DUF218  29.46 
 
 		 228 aa  48.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01585  hypothetical protein  25.55 
 
 		 268 aa  47.4  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2025  protein of unknown function DUF218  33.03 
 
 		 216 aa  47  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0343136  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0757  hypothetical protein  25.42 
 
 		 207 aa  47  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482457  hitchhiker  0.00142809 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1021  hypothetical protein  30.77 
 
 		 267 aa  47  0.0006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47504  normal  0.0154431 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2124  hypothetical protein  25.98 
 
 		 185 aa  46.6  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2062  hypothetical protein  25.98 
 
 		 185 aa  46.6  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.59257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2278  hypothetical protein  25.98 
 
 		 185 aa  46.6  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2304  hypothetical protein  25.98 
 
 		 185 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.195603 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2459  protein of unknown function DUF218  32.48 
 
 		 256 aa  46.2  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2167  protein of unknown function DUF218  27.93 
 
 		 194 aa  46.2  0.0009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000011898 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4635  hypothetical protein  27.78 
 
 		 189 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.940029  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0438  protein of unknown function DUF218  25.45 
 
 		 215 aa  45.8  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1772  hypothetical protein  31.36 
 
 		 262 aa  45.8  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442971  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003938  membrane protein functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  25.78 
 
 		 261 aa  45.4  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0113551  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2281  protein of unknown function DUF218  27.27 
 
 		 198 aa  45.8  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00040439  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2653  protein of unknown function DUF218  26.47 
 
 		 199 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.344395 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0316  hypothetical protein  25 
 
 		 345 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2325  hypothetical protein  26.09 
 
 		 270 aa  45.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1366  hypothetical protein  29.73 
 
 		 266 aa  45.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.90388  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0162  hypothetical protein  29.32 
 
 		 247 aa  45.1  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1763  hypothetical protein  26 
 
 		 252 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4460  hypothetical protein  25 
 
 		 267 aa  44.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472125  normal  0.336495 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6345  hypothetical protein  30.69 
 
 		 273 aa  44.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.842525  hitchhiker  0.00886625 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1673  hypothetical protein  23.97 
 
 		 284 aa  45.1  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.255885 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2058  hypothetical protein  26.19 
 
 		 185 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0668  hypothetical protein  31.52 
 
 		 255 aa  44.3  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2734  hypothetical protein  28.89 
 
 		 167 aa  43.9  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.315945 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1372  hypothetical protein  25.6 
 
 		 224 aa  43.9  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.564686  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1217  hypothetical protein  29.59 
 
 		 219 aa  43.9  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4954  hypothetical protein  26.76 
 
 		 345 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4694  hypothetical protein  25 
 
 		 345 aa  43.9  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>