193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1927 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1927  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 		 381 aa  771    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3687  tetratricopeptide TPR_2  96.59 
 
 		 381 aa  723    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  24.57 
 
 		 1094 aa  73.9  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  25.75 
 
 		 561 aa  72.4  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  25.37 
 
 		 561 aa  70.1  0.00000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1987  TPR domain-containing protein  23.02 
 
 		 864 aa  66.6  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  23.69 
 
 		 1979 aa  64.7  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0376  tetratricopeptide TPR_4  25.48 
 
 		 929 aa  63.9  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  26.82 
 
 		 573 aa  63.5  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0195  TPR repeat-containing protein  25.75 
 
 		 931 aa  61.6  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.18 
 
 		 2240 aa  62  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0823  TPR repeat-containing protein  24.42 
 
 		 502 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  25.91 
 
 		 1737 aa  60.8  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  26.74 
 
 		 863 aa  60.1  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  21.74 
 
 		 577 aa  59.3  0.00000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  22.57 
 
 		 577 aa  57.8  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  23.71 
 
 		 4079 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  25.38 
 
 		 1276 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  23.47 
 
 		 3560 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  25.67 
 
 		 603 aa  57.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  19.23 
 
 		 356 aa  55.8  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0516  TPR repeat-containing protein  22.31 
 
 		 673 aa  56.2  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000776603  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  18.82 
 
 		 758 aa  56.2  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  22.22 
 
 		 634 aa  55.5  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  22.44 
 
 		 750 aa  54.7  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0911  TPR repeat-containing protein  24.89 
 
 		 515 aa  55.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.19098  hitchhiker  0.00518464 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  21.79 
 
 		 3145 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  20.34 
 
 		 594 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2284  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.78 
 
 		 422 aa  54.3  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.926786  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1158  TPR repeat-containing protein  27.37 
 
 		 315 aa  54.3  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.804036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  21.97 
 
 		 860 aa  53.9  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1212  TPR domain-containing protein  22.76 
 
 		 337 aa  53.9  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.835664 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  24.78 
 
 		 808 aa  53.9  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3191  TPR domain-containing protein  24.1 
 
 		 638 aa  53.1  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1362  TPR repeat-containing protein  23.39 
 
 		 376 aa  52.8  0.000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  22.58 
 
 		 392 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  21.64 
 
 		 409 aa  52.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1609  TPR repeat-containing protein  23.78 
 
 		 194 aa  52.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.994867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  23.58 
 
 		 1067 aa  52  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0684  TPR repeat-containing protein  24.76 
 
 		 626 aa  52  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.073347 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  22.03 
 
 		 3035 aa  51.6  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  28.26 
 
 		 1676 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  23.32 
 
 		 979 aa  51.2  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.55 
 
 		 1034 aa  51.2  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  24.16 
 
 		 685 aa  50.8  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0424  TPR repeat-containing protein  31.3 
 
 		 313 aa  50.8  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.446862  normal  0.0100173 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3128  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  28.86 
 
 		 332 aa  50.8  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  22.71 
 
 		 828 aa  50.8  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16401  hypothetical protein  25.13 
 
 		 779 aa  50.8  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.659248 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  20 
 
 		 409 aa  50.4  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0276  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.36 
 
 		 624 aa  50.4  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  22.17 
 
 		 486 aa  50.4  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3721  sulfotransferase  25 
 
 		 637 aa  50.4  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.15 
 
 		 784 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  29.85 
 
 		 594 aa  50.4  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2480  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  20.32 
 
 		 882 aa  50.1  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  26.62 
 
 		 567 aa  50.1  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  22.63 
 
 		 750 aa  49.7  0.00008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2560  tetratricopeptide TPR_2  27.91 
 
 		 309 aa  49.7  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  22.35 
 
 		 681 aa  49.7  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1318  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 		 534 aa  49.7  0.00009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000693072  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  28.36 
 
 		 742 aa  49.7  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  25.21 
 
 		 1252 aa  49.7  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0738  TPR repeat-containing protein  22.27 
 
 		 323 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00630781  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0788  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 779 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.156743  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  23.86 
 
 		 4489 aa  49.3  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  25.62 
 
 		 397 aa  49.3  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  25.21 
 
 		 1252 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.86 
 
 		 739 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3925  TPR repeat-containing protein  22.63 
 
 		 1180 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  22.4 
 
 		 828 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  24.41 
 
 		 1005 aa  48.1  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.12 
 
 		 629 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  23.88 
 
 		 592 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0689  TPR repeat-containing protein  20 
 
 		 632 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000734837  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  23.11 
 
 		 520 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  23.13 
 
 		 1013 aa  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  26.85 
 
 		 928 aa  48.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1837  TPR repeat-containing protein  24.28 
 
 		 344 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0604  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.16 
 
 		 878 aa  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0912  TPR repeat-containing protein  28.99 
 
 		 748 aa  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.795031  hitchhiker  0.00626987 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0915  TPR repeat-containing protein  30.63 
 
 		 324 aa  47.8  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051049 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.28 
 
 		 344 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00371  hypothetical protein  32.41 
 
 		 529 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2555  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.14 
 
 		 250 aa  47.8  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.58946e-23 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  19.05 
 
 		 833 aa  48.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1767  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  21.86 
 
 		 882 aa  47.8  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0539  TPR repeat-containing protein  21.15 
 
 		 389 aa  47.4  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0475117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3697  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.66 
 
 		 293 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0362  TPR repeat-containing protein  23.35 
 
 		 804 aa  47.4  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.587657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  25.85 
 
 		 865 aa  47.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0121  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 576 aa  47  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.416255 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2439  TPR repeat-containing protein  25.09 
 
 		 923 aa  47  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.427579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2185  tetratricopeptide repeat protein  23.67 
 
 		 1400 aa  47  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1755  Flp pilus assembly protein TadD  23.16 
 
 		 321 aa  47  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  23.47 
 
 		 505 aa  47  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  27.66 
 
 		 3301 aa  47  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2400  TPR repeat-containing protein  25.48 
 
 		 520 aa  47  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.38799 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3197  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  27.61 
 
 		 395 aa  47  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187148  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  19.4 
 
 		 883 aa  46.6  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>