118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0277 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0277  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 354 aa  737    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1477  glycosyl transferase  56.76 
 
 		 333 aa  387  1e-106  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0984787  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0384  glycosyl transferase  53.27 
 
 		 384 aa  374  1e-102  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2590  glycosyltransferase  33.12 
 
 		 331 aa  157  3e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0360925  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2859  glycosyl transferase group 1  30.75 
 
 		 368 aa  150  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3711  glycosyl transferase group 1  28.34 
 
 		 371 aa  150  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.102739  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1274  glycosyl transferase, group 1  29.51 
 
 		 359 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.204906  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0618  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.81 
 
 		 366 aa  145  9e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0003  glycosyl transferase, group 1  32.88 
 
 		 354 aa  145  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3800  putative glycosyl transferase  27.89 
 
 		 355 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.383536 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2728  glycosyl transferase, group 1  29.83 
 
 		 372 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0667  glycosyl transferase, group 1  28.03 
 
 		 360 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3989  glycosyl transferase, group 1  25.78 
 
 		 361 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2522  glycosyltransferase  28.14 
 
 		 339 aa  127  3e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5371  glycosyl transferase, group 1  29.76 
 
 		 352 aa  125  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.624756  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1347  glycosyl transferase group 1  31.17 
 
 		 367 aa  124  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.963322 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30020  Glycosyl transferase, group 1 family protein  30.18 
 
 		 361 aa  120  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.349292  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0063  a-glycosyltransferase  30.25 
 
 		 361 aa  118  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.15897  normal  0.0344748 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4264  glycosyl transferase, group 1  25.68 
 
 		 364 aa  117  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2338  glycosyl transferase, group 1  29.01 
 
 		 359 aa  116  5e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0629  glycosyl transferase, group 1  30.94 
 
 		 356 aa  110  3e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.325985 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2650  glycosyl transferase, group 1  27.02 
 
 		 357 aa  105  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3797  hypothetical protein  32.99 
 
 		 1444 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3645  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 386 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243926 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0291  glycosyl transferase, group 1  31.43 
 
 		 740 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0775  glycosyl transferase, group 1  31.43 
 
 		 740 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0686  hypothetical protein  32.46 
 
 		 371 aa  60.5  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3169  glycosyl transferase, group 1  21.97 
 
 		 456 aa  56.6  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0634  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.33 
 
 		 398 aa  55.8  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2166  glycosyl transferase group 1  29.76 
 
 		 828 aa  55.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0668  glycosyl transferase, group 1  39.68 
 
 		 378 aa  54.7  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000385091 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3647  glycosyl transferase group 1  24.26 
 
 		 384 aa  53.1  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79128  hitchhiker  0.000752114 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4069  glycosyltransferase-like protein  23.56 
 
 		 398 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.269356  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2737  glycosyl transferase group 1  36.67 
 
 		 416 aa  51.2  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.829529  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3331  glycosyl transferase group 1  27.38 
 
 		 343 aa  51.2  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1056  glycosyl transferase group 1  25.1 
 
 		 550 aa  51.6  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0528  glycosyl transferase, group 1  39.66 
 
 		 406 aa  51.2  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000105595  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0542  glycosyl transferase group 1  39.66 
 
 		 406 aa  50.8  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000128948  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2477  glycosyl transferase, group 1  31.08 
 
 		 382 aa  50.4  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.748103  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  32.5 
 
 		 1476 aa  50.4  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0766  glycosyl transferase, group 1  27.4 
 
 		 339 aa  50.1  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1786  glycosyl transferase, putative  26.05 
 
 		 1147 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0129098 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  21.61 
 
 		 2401 aa  48.9  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  24.35 
 
 		 427 aa  49.3  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4161  glycosyl transferase, group 1  29.17 
 
 		 382 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4205  glycosyl transferase, group 1  29.17 
 
 		 382 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.384396 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  29.7 
 
 		 399 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5020  hypothetical protein  25.27 
 
 		 348 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.848752 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3311  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 		 382 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  34.78 
 
 		 369 aa  49.3  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3804  glycosyl transferase group 1  25.62 
 
 		 387 aa  48.9  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5127  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.6 
 
 		 413 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.773253  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  32.14 
 
 		 360 aa  48.1  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5519  group 1 family glycosyl transferase  24.6 
 
 		 413 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0413  glycosyl transferase, group 1  30.95 
 
 		 386 aa  48.5  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.818994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5368  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.6 
 
 		 413 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4448  glycosyl transferase, group 1  33.73 
 
 		 428 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2606  glycosyl transferase group 1  26.23 
 
 		 398 aa  47.8  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0017  glycosyl transferase group 1  32.38 
 
 		 356 aa  47.8  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.689138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  24.39 
 
 		 409 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1367  glycosyltransferase-like protein  21.48 
 
 		 1608 aa  47.4  0.0004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0176996  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0170  glycosyl transferase group 1  23.74 
 
 		 394 aa  47  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.269733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3573  glycosyl transferase, group 1  30.49 
 
 		 378 aa  47  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.823094  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0145  hypothetical protein  23.67 
 
 		 414 aa  46.6  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 391 aa  46.2  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0462  glycosyl transferase group 1  19.17 
 
 		 408 aa  46.2  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  23.46 
 
 		 860 aa  46.2  0.0009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1149  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.51 
 
 		 375 aa  45.8  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  27.78 
 
 		 394 aa  45.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2914  glycosyl transferase, group 1  30.3 
 
 		 342 aa  45.8  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  36.67 
 
 		 392 aa  45.4  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2593  glycosyl transferase family protein  24.84 
 
 		 1187 aa  46.2  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.842346  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2637  glycosyl transferase, group 1  29.49 
 
 		 345 aa  45.8  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1460  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  23.7 
 
 		 374 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0801  glycosyl transferase group 1  38.18 
 
 		 388 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2281  glycosyl transferase, group 1  21.2 
 
 		 389 aa  45.8  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1957  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.37 
 
 		 366 aa  45.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4699  glycosyl transferase, group 1  23.19 
 
 		 409 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 		 388 aa  45.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3626  glycosyl transferase, group 1  29.85 
 
 		 393 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0036  glycosyl transferase group 1  26.19 
 
 		 381 aa  45.4  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2609  UDP-N-acetylglucosamine  24.03 
 
 		 420 aa  45.1  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070619 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19360  hypothetical protein  27.22 
 
 		 319 aa  44.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1555  glycosyl transferase family 2  29.81 
 
 		 1188 aa  45.1  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0315  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 339 aa  44.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  25.62 
 
 		 414 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2463  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.03 
 
 		 249 aa  44.7  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3987  glycosyl transferase, group 1  31.17 
 
 		 378 aa  44.3  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.107923 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2027  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 		 360 aa  44.3  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000425706  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1641  glycosyl transferase, group 1  29.55 
 
 		 390 aa  44.3  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2394  glycosyl transferase, group 1  29.17 
 
 		 395 aa  44.7  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  25.27 
 
 		 377 aa  44.7  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1212  TatD family deoxyribonuclease  31.03 
 
 		 371 aa  44.3  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08810  glycosyltransferase  29.47 
 
 		 564 aa  44.3  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139018  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.95 
 
 		 407 aa  43.9  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  21.88 
 
 		 398 aa  43.9  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4401  glycosyl transferase group 1  29.85 
 
 		 385 aa  43.9  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2570  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 402 aa  43.9  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0408  glycosyl transferase group 1  25.58 
 
 		 410 aa  43.9  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0705  glycosyl transferase group 1  32.91 
 
 		 353 aa  44.3  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>