53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5020 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5020  hypothetical protein  100 
 
 		 348 aa  696    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.848752 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  27.65 
 
 		 1359 aa  72  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2593  glycosyl transferase family protein  27.57 
 
 		 1187 aa  70.9  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.842346  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  26.97 
 
 		 1759 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4280  hypothetical protein  25.75 
 
 		 1171 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1946  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.87 
 
 		 1191 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06183  O-antigen biosynthesis protein  26.49 
 
 		 1165 aa  68.9  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00444077  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00983  O-antigen biosynthesis protein  26.49 
 
 		 1165 aa  68.9  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2650  glycosyl transferase family protein  26.54 
 
 		 1177 aa  66.2  0.0000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3122  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.45 
 
 		 516 aa  65.1  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3469  glycosyl transferase family protein  23.73 
 
 		 1190 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.65715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1508  glycosyl transferase family protein  23.32 
 
 		 1198 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1555  glycosyl transferase family 2  23.61 
 
 		 1188 aa  62.8  0.000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3298  hypothetical protein  26.89 
 
 		 333 aa  61.6  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0661206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1100  glycosyl transferase group 1  34.51 
 
 		 924 aa  59.3  0.00000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0775  glycosyl transferase, group 1  37.65 
 
 		 740 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0291  glycosyl transferase, group 1  37.65 
 
 		 740 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2166  glycosyl transferase group 1  42.86 
 
 		 828 aa  54.3  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3645  glycosyl transferase group 1  38.2 
 
 		 386 aa  53.5  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243926 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3720  glycosyl transferase family protein  23.5 
 
 		 1193 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2522  glycosyltransferase  37.97 
 
 		 339 aa  53.5  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2590  glycosyltransferase  21.17 
 
 		 331 aa  52.8  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0360925  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1786  glycosyl transferase, putative  40.98 
 
 		 1147 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0129098 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4069  glycosyltransferase-like protein  21.9 
 
 		 398 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.269356  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  33.83 
 
 		 2401 aa  51.6  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3711  glycosyl transferase group 1  23.01 
 
 		 371 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.102739  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50300  hypothetical protein  27.82 
 
 		 1694 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0552832  decreased coverage  0.000853187 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1476  glycosyl transferase family protein  23.28 
 
 		 1192 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.891442 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0277  glycosyl transferase group 1  25.27 
 
 		 354 aa  48.9  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4205  Glycosyltransferase-like protein  32.89 
 
 		 372 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2886  glycosyl transferase family 2  23.24 
 
 		 1213 aa  47  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.242978  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  29.73 
 
 		 1476 aa  46.6  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3989  glycosyl transferase, group 1  35.82 
 
 		 361 aa  46.6  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5335  hypothetical protein  26.64 
 
 		 341 aa  46.6  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5354  hypothetical protein  23.96 
 
 		 340 aa  46.2  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0686  hypothetical protein  37.84 
 
 		 371 aa  46.2  0.0009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3409  glycosyl transferase group 1  28.25 
 
 		 358 aa  45.8  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1502  hypothetical protein  35.71 
 
 		 344 aa  45.8  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5371  glycosyl transferase, group 1  31.43 
 
 		 352 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.624756  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2617  hypothetical protein  33.07 
 
 		 391 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3647  glycosyl transferase group 1  38.67 
 
 		 384 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79128  hitchhiker  0.000752114 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1102  glycosyl transferase family 2  37.31 
 
 		 953 aa  44.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0003  glycosyl transferase, group 1  38.16 
 
 		 354 aa  45.1  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  31.17 
 
 		 1177 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3797  hypothetical protein  36.36 
 
 		 1444 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  29.87 
 
 		 1177 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1918  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.14 
 
 		 1173 aa  43.9  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0063  a-glycosyltransferase  24.02 
 
 		 361 aa  43.9  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.15897  normal  0.0344748 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  23.79 
 
 		 3172 aa  43.9  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1274  glycosyl transferase, group 1  33.77 
 
 		 359 aa  43.5  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.204906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7628  Glycosyltransferase-like protein  27.42 
 
 		 372 aa  43.5  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.294474  normal  0.180766 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2650  glycosyl transferase, group 1  34.85 
 
 		 357 aa  43.5  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2759  hypothetical protein  35.9 
 
 		 338 aa  43.5  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.676094  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>